Protein–RNA interactions for Protein: P49642

PRIM1, DNA primase small subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM1P49642 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRIM1P49642 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRIM1P49642 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRIM1P49642 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRIM1P49642 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRIM1P49642 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PRIM1P49642 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRIM1P49642 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PRIM1P49642 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRIM1P49642 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRIM1P49642 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRIM1P49642 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRIM1P49642 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRIM1P49642 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PRIM1P49642 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRIM1P49642 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRIM1P49642 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PRIM1P49642 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PRIM1P49642 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PRIM1P49642 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PRIM1P49642 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PRIM1P49642 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
PRIM1P49642 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PRIM1P49642 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PRIM1P49642 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRIM1P49642 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRIM1P49642 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRIM1P49642 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PRIM1P49642 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRIM1P49642 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRIM1P49642 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PRIM1P49642 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRIM1P49642 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRIM1P49642 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PRIM1P49642 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRIM1P49642 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRIM1P49642 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRIM1P49642 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRIM1P49642 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRIM1P49642 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRIM1P49642 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRIM1P49642 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRIM1P49642 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRIM1P49642 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRIM1P49642 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRIM1P49642 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRIM1P49642 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PRIM1P49642 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PRIM1P49642 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRIM1P49642 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRIM1P49642 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRIM1P49642 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRIM1P49642 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRIM1P49642 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRIM1P49642 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRIM1P49642 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRIM1P49642 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRIM1P49642 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRIM1P49642 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRIM1P49642 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRIM1P49642 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRIM1P49642 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRIM1P49642 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRIM1P49642 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRIM1P49642 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRIM1P49642 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRIM1P49642 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PRIM1P49642 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRIM1P49642 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRIM1P49642 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRIM1P49642 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRIM1P49642 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRIM1P49642 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRIM1P49642 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRIM1P49642 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRIM1P49642 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRIM1P49642 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PRIM1P49642 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRIM1P49642 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PRIM1P49642 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PRIM1P49642 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRIM1P49642 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRIM1P49642 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRIM1P49642 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRIM1P49642 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRIM1P49642 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRIM1P49642 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRIM1P49642 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PRIM1P49642 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRIM1P49642 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRIM1P49642 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PRIM1P49642 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRIM1P49642 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRIM1P49642 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRIM1P49642 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRIM1P49642 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRIM1P49642 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRIM1P49642 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PRIM1P49642 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRIM1P49642 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms