Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ME1P48163 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ME1P48163 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ME1P48163 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ME1P48163 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ME1P48163 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ME1P48163 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ME1P48163 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ME1P48163 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ME1P48163 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ME1P48163 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ME1P48163 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ME1P48163 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ME1P48163 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ME1P48163 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ME1P48163 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ME1P48163 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ME1P48163 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ME1P48163 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ME1P48163 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ME1P48163 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ME1P48163 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ME1P48163 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ME1P48163 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ME1P48163 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ME1P48163 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ME1P48163 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ME1P48163 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ME1P48163 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ME1P48163 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ME1P48163 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ME1P48163 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ME1P48163 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ME1P48163 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ME1P48163 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ME1P48163 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ME1P48163 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ME1P48163 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ME1P48163 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ME1P48163 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ME1P48163 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ME1P48163 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ME1P48163 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ME1P48163 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ME1P48163 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ME1P48163 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ME1P48163 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ME1P48163 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ME1P48163 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ME1P48163 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ME1P48163 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ME1P48163 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ME1P48163 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ME1P48163 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ME1P48163 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ME1P48163 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ME1P48163 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ME1P48163 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ME1P48163 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ME1P48163 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ME1P48163 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ME1P48163 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ME1P48163 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ME1P48163 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ME1P48163 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ME1P48163 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ME1P48163 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ME1P48163 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ME1P48163 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ME1P48163 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ME1P48163 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ME1P48163 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ME1P48163 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ME1P48163 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ME1P48163 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ME1P48163 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ME1P48163 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ME1P48163 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ME1P48163 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ME1P48163 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ME1P48163 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ME1P48163 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ME1P48163 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ME1P48163 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ME1P48163 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ME1P48163 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ME1P48163 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ME1P48163 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ME1P48163 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ME1P48163 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ME1P48163 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ME1P48163 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ME1P48163 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ME1P48163 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ME1P48163 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ME1P48163 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ME1P48163 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ME1P48163 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ME1P48163 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ME1P48163 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms