Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ACADSBP45954 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ACADSBP45954 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ACADSBP45954 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ACADSBP45954 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ACADSBP45954 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ACADSBP45954 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ACADSBP45954 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ACADSBP45954 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ACADSBP45954 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ACADSBP45954 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ACADSBP45954 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ACADSBP45954 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ACADSBP45954 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ACADSBP45954 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ACADSBP45954 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ACADSBP45954 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ACADSBP45954 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ACADSBP45954 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ACADSBP45954 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ACADSBP45954 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ACADSBP45954 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ACADSBP45954 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ACADSBP45954 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ACADSBP45954 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ACADSBP45954 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ACADSBP45954 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ACADSBP45954 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ACADSBP45954 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ACADSBP45954 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ACADSBP45954 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ACADSBP45954 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ACADSBP45954 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ACADSBP45954 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
ACADSBP45954 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ACADSBP45954 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ACADSBP45954 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ACADSBP45954 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ACADSBP45954 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ACADSBP45954 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ACADSBP45954 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ACADSBP45954 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ACADSBP45954 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ACADSBP45954 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ACADSBP45954 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ACADSBP45954 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ACADSBP45954 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ACADSBP45954 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms