Protein–RNA interactions for Protein: P43007

SLC1A4, Neutral amino acid transporter A, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A4P43007 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC1A4P43007 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC1A4P43007 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC1A4P43007 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC1A4P43007 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC1A4P43007 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC1A4P43007 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC1A4P43007 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC1A4P43007 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC1A4P43007 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC1A4P43007 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC1A4P43007 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC1A4P43007 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC1A4P43007 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC1A4P43007 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC1A4P43007 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC1A4P43007 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC1A4P43007 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC1A4P43007 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC1A4P43007 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC1A4P43007 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC1A4P43007 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC1A4P43007 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC1A4P43007 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC1A4P43007 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC1A4P43007 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC1A4P43007 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC1A4P43007 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC1A4P43007 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC1A4P43007 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC1A4P43007 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC1A4P43007 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC1A4P43007 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC1A4P43007 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC1A4P43007 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC1A4P43007 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC1A4P43007 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC1A4P43007 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC1A4P43007 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC1A4P43007 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC1A4P43007 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC1A4P43007 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC1A4P43007 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC1A4P43007 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC1A4P43007 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC1A4P43007 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC1A4P43007 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC1A4P43007 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC1A4P43007 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC1A4P43007 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC1A4P43007 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC1A4P43007 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC1A4P43007 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC1A4P43007 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC1A4P43007 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC1A4P43007 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC1A4P43007 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC1A4P43007 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC1A4P43007 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC1A4P43007 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC1A4P43007 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC1A4P43007 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC1A4P43007 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC1A4P43007 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC1A4P43007 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC1A4P43007 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC1A4P43007 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC1A4P43007 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC1A4P43007 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC1A4P43007 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC1A4P43007 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC1A4P43007 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC1A4P43007 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC1A4P43007 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC1A4P43007 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC1A4P43007 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC1A4P43007 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC1A4P43007 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC1A4P43007 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC1A4P43007 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC1A4P43007 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC1A4P43007 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC1A4P43007 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC1A4P43007 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC1A4P43007 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC1A4P43007 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC1A4P43007 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC1A4P43007 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC1A4P43007 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC1A4P43007 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC1A4P43007 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC1A4P43007 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC1A4P43007 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC1A4P43007 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC1A4P43007 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC1A4P43007 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC1A4P43007 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC1A4P43007 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC1A4P43007 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC1A4P43007 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms