Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
APOBEC1P41238 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.8 ms