Protein–RNA interactions for Protein: P35125

USP6, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6P35125 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP6P35125 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP6P35125 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP6P35125 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP6P35125 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP6P35125 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP6P35125 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP6P35125 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP6P35125 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
USP6P35125 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP6P35125 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP6P35125 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
USP6P35125 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP6P35125 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP6P35125 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP6P35125 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP6P35125 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP6P35125 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP6P35125 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
USP6P35125 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP6P35125 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP6P35125 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP6P35125 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP6P35125 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP6P35125 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
USP6P35125 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP6P35125 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP6P35125 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP6P35125 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP6P35125 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP6P35125 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP6P35125 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP6P35125 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP6P35125 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP6P35125 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP6P35125 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP6P35125 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP6P35125 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP6P35125 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP6P35125 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP6P35125 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP6P35125 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP6P35125 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP6P35125 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP6P35125 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP6P35125 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP6P35125 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
USP6P35125 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP6P35125 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP6P35125 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP6P35125 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP6P35125 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP6P35125 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP6P35125 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP6P35125 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP6P35125 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP6P35125 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP6P35125 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP6P35125 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP6P35125 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP6P35125 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
USP6P35125 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
USP6P35125 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
USP6P35125 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP6P35125 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP6P35125 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP6P35125 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP6P35125 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP6P35125 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP6P35125 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP6P35125 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP6P35125 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP6P35125 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP6P35125 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP6P35125 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP6P35125 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP6P35125 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
USP6P35125 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
USP6P35125 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
USP6P35125 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP6P35125 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP6P35125 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP6P35125 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
USP6P35125 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP6P35125 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP6P35125 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP6P35125 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP6P35125 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP6P35125 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP6P35125 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP6P35125 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP6P35125 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP6P35125 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP6P35125 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP6P35125 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP6P35125 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
USP6P35125 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP6P35125 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP6P35125 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP6P35125 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms