Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
OTX2P32243 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
OTX2P32243 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
OTX2P32243 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
OTX2P32243 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
OTX2P32243 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
OTX2P32243 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
OTX2P32243 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
OTX2P32243 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
OTX2P32243 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
OTX2P32243 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
OTX2P32243 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
OTX2P32243 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
OTX2P32243 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
OTX2P32243 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
OTX2P32243 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
OTX2P32243 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
OTX2P32243 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
OTX2P32243 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
OTX2P32243 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
OTX2P32243 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
OTX2P32243 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
OTX2P32243 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
OTX2P32243 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
OTX2P32243 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
OTX2P32243 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
OTX2P32243 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
OTX2P32243 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
OTX2P32243 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
OTX2P32243 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
OTX2P32243 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
OTX2P32243 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
OTX2P32243 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
OTX2P32243 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
OTX2P32243 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
OTX2P32243 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTX2P32243 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTX2P32243 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTX2P32243 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTX2P32243 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTX2P32243 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTX2P32243 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTX2P32243 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTX2P32243 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
OTX2P32243 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTX2P32243 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTX2P32243 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTX2P32243 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTX2P32243 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTX2P32243 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTX2P32243 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTX2P32243 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTX2P32243 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTX2P32243 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTX2P32243 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTX2P32243 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTX2P32243 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTX2P32243 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTX2P32243 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
OTX2P32243 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
OTX2P32243 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
OTX2P32243 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
OTX2P32243 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
OTX2P32243 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
OTX2P32243 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
OTX2P32243 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
OTX2P32243 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
OTX2P32243 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
OTX2P32243 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
OTX2P32243 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
OTX2P32243 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
OTX2P32243 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
OTX2P32243 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
OTX2P32243 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
OTX2P32243 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
OTX2P32243 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
OTX2P32243 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
OTX2P32243 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
OTX2P32243 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
OTX2P32243 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
OTX2P32243 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
OTX2P32243 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
OTX2P32243 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
OTX2P32243 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
OTX2P32243 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
OTX2P32243 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
OTX2P32243 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
OTX2P32243 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
OTX2P32243 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
OTX2P32243 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
OTX2P32243 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
OTX2P32243 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
OTX2P32243 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
OTX2P32243 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
OTX2P32243 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
OTX2P32243 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
OTX2P32243 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
OTX2P32243 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
OTX2P32243 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
OTX2P32243 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms