Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXA13P31271 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXA13P31271 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXA13P31271 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXA13P31271 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXA13P31271 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXA13P31271 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXA13P31271 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXA13P31271 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXA13P31271 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXA13P31271 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXA13P31271 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXA13P31271 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXA13P31271 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXA13P31271 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXA13P31271 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXA13P31271 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXA13P31271 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXA13P31271 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXA13P31271 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXA13P31271 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXA13P31271 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXA13P31271 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXA13P31271 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXA13P31271 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXA13P31271 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXA13P31271 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXA13P31271 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXA13P31271 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXA13P31271 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXA13P31271 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXA13P31271 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXA13P31271 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXA13P31271 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXA13P31271 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXA13P31271 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXA13P31271 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXA13P31271 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXA13P31271 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXA13P31271 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXA13P31271 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXA13P31271 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXA13P31271 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXA13P31271 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXA13P31271 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXA13P31271 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXA13P31271 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXA13P31271 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXA13P31271 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXA13P31271 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXA13P31271 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXA13P31271 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXA13P31271 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXA13P31271 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXA13P31271 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXA13P31271 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXA13P31271 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXA13P31271 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXA13P31271 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXA13P31271 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXA13P31271 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXA13P31271 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXA13P31271 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXA13P31271 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXA13P31271 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXA13P31271 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXA13P31271 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXA13P31271 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXA13P31271 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXA13P31271 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXA13P31271 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXA13P31271 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXA13P31271 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXA13P31271 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXA13P31271 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXA13P31271 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXA13P31271 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXA13P31271 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXA13P31271 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXA13P31271 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXA13P31271 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXA13P31271 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXA13P31271 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXA13P31271 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXA13P31271 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXA13P31271 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXA13P31271 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXA13P31271 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXA13P31271 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXA13P31271 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXA13P31271 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXA13P31271 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
HOXA13P31271 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXA13P31271 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXA13P31271 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXA13P31271 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXA13P31271 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXA13P31271 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXA13P31271 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXA13P31271 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms