Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HMGB2P26583 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HMGB2P26583 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HMGB2P26583 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HMGB2P26583 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HMGB2P26583 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HMGB2P26583 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HMGB2P26583 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HMGB2P26583 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HMGB2P26583 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HMGB2P26583 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HMGB2P26583 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HMGB2P26583 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HMGB2P26583 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HMGB2P26583 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HMGB2P26583 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HMGB2P26583 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HMGB2P26583 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HMGB2P26583 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC25■■□□□ 1.59
HMGB2P26583 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC25■■□□□ 1.59
HMGB2P26583 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
HMGB2P26583 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HMGB2P26583 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HMGB2P26583 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HMGB2P26583 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HMGB2P26583 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HMGB2P26583 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HMGB2P26583 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HMGB2P26583 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HMGB2P26583 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HMGB2P26583 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HMGB2P26583 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HMGB2P26583 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HMGB2P26583 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HMGB2P26583 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HMGB2P26583 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HMGB2P26583 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HMGB2P26583 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
HMGB2P26583 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HMGB2P26583 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HMGB2P26583 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HMGB2P26583 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HMGB2P26583 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HMGB2P26583 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HMGB2P26583 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HMGB2P26583 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HMGB2P26583 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
HMGB2P26583 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HMGB2P26583 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HMGB2P26583 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HMGB2P26583 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HMGB2P26583 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HMGB2P26583 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HMGB2P26583 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
HMGB2P26583 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HMGB2P26583 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
HMGB2P26583 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HMGB2P26583 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HMGB2P26583 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
HMGB2P26583 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HMGB2P26583 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HMGB2P26583 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HMGB2P26583 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HMGB2P26583 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HMGB2P26583 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HMGB2P26583 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
HMGB2P26583 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HMGB2P26583 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HMGB2P26583 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
HMGB2P26583 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HMGB2P26583 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
HMGB2P26583 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HMGB2P26583 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HMGB2P26583 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HMGB2P26583 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HMGB2P26583 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HMGB2P26583 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HMGB2P26583 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
HMGB2P26583 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HMGB2P26583 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HMGB2P26583 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HMGB2P26583 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
HMGB2P26583 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HMGB2P26583 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HMGB2P26583 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HMGB2P26583 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HMGB2P26583 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HMGB2P26583 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
HMGB2P26583 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
HMGB2P26583 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HMGB2P26583 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HMGB2P26583 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HMGB2P26583 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
HMGB2P26583 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HMGB2P26583 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HMGB2P26583 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HMGB2P26583 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HMGB2P26583 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HMGB2P26583 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HMGB2P26583 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms