Protein–RNA interactions for Protein: P23443

RPS6KB1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1P23443 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPS6KB1P23443 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPS6KB1P23443 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPS6KB1P23443 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPS6KB1P23443 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
RPS6KB1P23443 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
RPS6KB1P23443 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
RPS6KB1P23443 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
RPS6KB1P23443 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPS6KB1P23443 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPS6KB1P23443 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPS6KB1P23443 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPS6KB1P23443 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPS6KB1P23443 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPS6KB1P23443 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPS6KB1P23443 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPS6KB1P23443 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPS6KB1P23443 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPS6KB1P23443 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPS6KB1P23443 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPS6KB1P23443 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPS6KB1P23443 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPS6KB1P23443 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPS6KB1P23443 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPS6KB1P23443 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPS6KB1P23443 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPS6KB1P23443 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPS6KB1P23443 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPS6KB1P23443 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPS6KB1P23443 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPS6KB1P23443 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPS6KB1P23443 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPS6KB1P23443 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPS6KB1P23443 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPS6KB1P23443 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPS6KB1P23443 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPS6KB1P23443 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPS6KB1P23443 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPS6KB1P23443 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPS6KB1P23443 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RPS6KB1P23443 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPS6KB1P23443 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPS6KB1P23443 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPS6KB1P23443 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPS6KB1P23443 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPS6KB1P23443 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPS6KB1P23443 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPS6KB1P23443 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPS6KB1P23443 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPS6KB1P23443 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPS6KB1P23443 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RPS6KB1P23443 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPS6KB1P23443 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPS6KB1P23443 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPS6KB1P23443 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPS6KB1P23443 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPS6KB1P23443 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPS6KB1P23443 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPS6KB1P23443 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPS6KB1P23443 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPS6KB1P23443 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPS6KB1P23443 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPS6KB1P23443 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPS6KB1P23443 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPS6KB1P23443 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPS6KB1P23443 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPS6KB1P23443 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RPS6KB1P23443 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPS6KB1P23443 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPS6KB1P23443 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPS6KB1P23443 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPS6KB1P23443 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPS6KB1P23443 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPS6KB1P23443 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPS6KB1P23443 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPS6KB1P23443 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPS6KB1P23443 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RPS6KB1P23443 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPS6KB1P23443 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPS6KB1P23443 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPS6KB1P23443 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPS6KB1P23443 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPS6KB1P23443 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPS6KB1P23443 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RPS6KB1P23443 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPS6KB1P23443 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPS6KB1P23443 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPS6KB1P23443 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPS6KB1P23443 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPS6KB1P23443 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPS6KB1P23443 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPS6KB1P23443 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPS6KB1P23443 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPS6KB1P23443 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPS6KB1P23443 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPS6KB1P23443 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPS6KB1P23443 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPS6KB1P23443 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPS6KB1P23443 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPS6KB1P23443 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms