Protein–RNA interactions for Protein: P21127

CDK11B, Cyclin-dependent kinase 11B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11BP21127 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK11BP21127 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK11BP21127 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK11BP21127 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK11BP21127 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK11BP21127 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK11BP21127 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK11BP21127 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK11BP21127 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK11BP21127 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK11BP21127 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK11BP21127 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK11BP21127 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK11BP21127 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK11BP21127 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK11BP21127 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK11BP21127 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK11BP21127 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK11BP21127 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK11BP21127 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK11BP21127 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK11BP21127 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK11BP21127 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK11BP21127 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK11BP21127 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK11BP21127 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK11BP21127 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK11BP21127 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK11BP21127 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK11BP21127 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK11BP21127 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK11BP21127 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK11BP21127 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDK11BP21127 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK11BP21127 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK11BP21127 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK11BP21127 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK11BP21127 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK11BP21127 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK11BP21127 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK11BP21127 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK11BP21127 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK11BP21127 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK11BP21127 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK11BP21127 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK11BP21127 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK11BP21127 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK11BP21127 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK11BP21127 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK11BP21127 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK11BP21127 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK11BP21127 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK11BP21127 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDK11BP21127 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CDK11BP21127 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CDK11BP21127 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CDK11BP21127 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK11BP21127 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK11BP21127 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK11BP21127 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK11BP21127 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK11BP21127 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK11BP21127 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK11BP21127 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK11BP21127 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK11BP21127 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK11BP21127 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK11BP21127 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK11BP21127 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK11BP21127 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK11BP21127 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK11BP21127 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK11BP21127 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK11BP21127 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK11BP21127 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK11BP21127 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK11BP21127 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK11BP21127 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK11BP21127 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK11BP21127 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK11BP21127 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDK11BP21127 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK11BP21127 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK11BP21127 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK11BP21127 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK11BP21127 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK11BP21127 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK11BP21127 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK11BP21127 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK11BP21127 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK11BP21127 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK11BP21127 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK11BP21127 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK11BP21127 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK11BP21127 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK11BP21127 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK11BP21127 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK11BP21127 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK11BP21127 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CDK11BP21127 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms