Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EFNA1P20827 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms