Protein–RNA interactions for Protein: P20138

CD33, Myeloid cell surface antigen CD33, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD33P20138 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD33P20138 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD33P20138 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD33P20138 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD33P20138 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD33P20138 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD33P20138 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD33P20138 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD33P20138 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CD33P20138 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD33P20138 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD33P20138 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD33P20138 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD33P20138 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD33P20138 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD33P20138 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD33P20138 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD33P20138 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD33P20138 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD33P20138 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD33P20138 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CD33P20138 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD33P20138 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD33P20138 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD33P20138 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD33P20138 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD33P20138 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD33P20138 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD33P20138 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD33P20138 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD33P20138 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD33P20138 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD33P20138 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD33P20138 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD33P20138 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD33P20138 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD33P20138 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD33P20138 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD33P20138 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD33P20138 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD33P20138 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD33P20138 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD33P20138 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD33P20138 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD33P20138 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD33P20138 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD33P20138 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD33P20138 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD33P20138 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD33P20138 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD33P20138 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD33P20138 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD33P20138 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD33P20138 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD33P20138 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CD33P20138 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD33P20138 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD33P20138 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD33P20138 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CD33P20138 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD33P20138 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD33P20138 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD33P20138 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD33P20138 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD33P20138 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD33P20138 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD33P20138 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD33P20138 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD33P20138 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD33P20138 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD33P20138 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD33P20138 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD33P20138 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD33P20138 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CD33P20138 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CD33P20138 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CD33P20138 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CD33P20138 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CD33P20138 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CD33P20138 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CD33P20138 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CD33P20138 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CD33P20138 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CD33P20138 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CD33P20138 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CD33P20138 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD33P20138 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CD33P20138 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD33P20138 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD33P20138 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD33P20138 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD33P20138 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD33P20138 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD33P20138 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD33P20138 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD33P20138 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD33P20138 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD33P20138 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD33P20138 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD33P20138 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms