Protein–RNA interactions for Protein: P19419

ELK1, ETS domain-containing protein Elk-1, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELK1P19419 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ELK1P19419 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ELK1P19419 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ELK1P19419 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ELK1P19419 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ELK1P19419 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ELK1P19419 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ELK1P19419 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ELK1P19419 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ELK1P19419 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ELK1P19419 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ELK1P19419 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ELK1P19419 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ELK1P19419 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ELK1P19419 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ELK1P19419 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ELK1P19419 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ELK1P19419 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ELK1P19419 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ELK1P19419 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ELK1P19419 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ELK1P19419 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ELK1P19419 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ELK1P19419 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ELK1P19419 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ELK1P19419 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ELK1P19419 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ELK1P19419 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ELK1P19419 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ELK1P19419 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ELK1P19419 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ELK1P19419 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ELK1P19419 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ELK1P19419 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ELK1P19419 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ELK1P19419 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ELK1P19419 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ELK1P19419 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ELK1P19419 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ELK1P19419 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ELK1P19419 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ELK1P19419 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ELK1P19419 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ELK1P19419 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ELK1P19419 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ELK1P19419 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ELK1P19419 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ELK1P19419 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ELK1P19419 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ELK1P19419 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ELK1P19419 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ELK1P19419 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ELK1P19419 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ELK1P19419 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ELK1P19419 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ELK1P19419 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ELK1P19419 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ELK1P19419 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ELK1P19419 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ELK1P19419 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ELK1P19419 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ELK1P19419 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ELK1P19419 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ELK1P19419 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ELK1P19419 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ELK1P19419 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ELK1P19419 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ELK1P19419 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ELK1P19419 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ELK1P19419 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ELK1P19419 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ELK1P19419 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ELK1P19419 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ELK1P19419 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ELK1P19419 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ELK1P19419 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ELK1P19419 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ELK1P19419 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ELK1P19419 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ELK1P19419 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ELK1P19419 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ELK1P19419 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ELK1P19419 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ELK1P19419 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ELK1P19419 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ELK1P19419 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ELK1P19419 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ELK1P19419 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ELK1P19419 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ELK1P19419 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ELK1P19419 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ELK1P19419 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ELK1P19419 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ELK1P19419 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ELK1P19419 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ELK1P19419 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ELK1P19419 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ELK1P19419 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ELK1P19419 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ELK1P19419 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms