Protein–RNA interactions for Protein: P17658

KCNA6, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 6, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA6P17658 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KCNA6P17658 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KCNA6P17658 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KCNA6P17658 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
KCNA6P17658 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KCNA6P17658 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
KCNA6P17658 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
KCNA6P17658 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KCNA6P17658 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KCNA6P17658 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KCNA6P17658 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KCNA6P17658 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KCNA6P17658 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
KCNA6P17658 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KCNA6P17658 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KCNA6P17658 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KCNA6P17658 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KCNA6P17658 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KCNA6P17658 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KCNA6P17658 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KCNA6P17658 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KCNA6P17658 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KCNA6P17658 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KCNA6P17658 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KCNA6P17658 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KCNA6P17658 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KCNA6P17658 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KCNA6P17658 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KCNA6P17658 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KCNA6P17658 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KCNA6P17658 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KCNA6P17658 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KCNA6P17658 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
KCNA6P17658 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KCNA6P17658 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KCNA6P17658 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KCNA6P17658 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KCNA6P17658 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KCNA6P17658 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KCNA6P17658 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KCNA6P17658 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
KCNA6P17658 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
KCNA6P17658 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
KCNA6P17658 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
KCNA6P17658 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
KCNA6P17658 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
KCNA6P17658 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
KCNA6P17658 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
KCNA6P17658 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
KCNA6P17658 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
KCNA6P17658 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
KCNA6P17658 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KCNA6P17658 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KCNA6P17658 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KCNA6P17658 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KCNA6P17658 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KCNA6P17658 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KCNA6P17658 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KCNA6P17658 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KCNA6P17658 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KCNA6P17658 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KCNA6P17658 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KCNA6P17658 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KCNA6P17658 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
KCNA6P17658 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KCNA6P17658 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KCNA6P17658 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KCNA6P17658 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KCNA6P17658 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KCNA6P17658 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KCNA6P17658 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KCNA6P17658 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
KCNA6P17658 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KCNA6P17658 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KCNA6P17658 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KCNA6P17658 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KCNA6P17658 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
KCNA6P17658 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
KCNA6P17658 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KCNA6P17658 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KCNA6P17658 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KCNA6P17658 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KCNA6P17658 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KCNA6P17658 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KCNA6P17658 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KCNA6P17658 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KCNA6P17658 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KCNA6P17658 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
KCNA6P17658 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KCNA6P17658 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
KCNA6P17658 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KCNA6P17658 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KCNA6P17658 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KCNA6P17658 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KCNA6P17658 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KCNA6P17658 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KCNA6P17658 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KCNA6P17658 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KCNA6P17658 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KCNA6P17658 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms