Protein–RNA interactions for Protein: P10966

CD8B, T-cell surface glycoprotein CD8 beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8BP10966 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD8BP10966 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CD8BP10966 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CD8BP10966 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD8BP10966 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD8BP10966 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD8BP10966 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD8BP10966 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD8BP10966 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD8BP10966 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD8BP10966 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD8BP10966 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD8BP10966 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD8BP10966 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD8BP10966 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CD8BP10966 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD8BP10966 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD8BP10966 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD8BP10966 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD8BP10966 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD8BP10966 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD8BP10966 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD8BP10966 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD8BP10966 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD8BP10966 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD8BP10966 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD8BP10966 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD8BP10966 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD8BP10966 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD8BP10966 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD8BP10966 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD8BP10966 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD8BP10966 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD8BP10966 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD8BP10966 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD8BP10966 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD8BP10966 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD8BP10966 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD8BP10966 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD8BP10966 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD8BP10966 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD8BP10966 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD8BP10966 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD8BP10966 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD8BP10966 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD8BP10966 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD8BP10966 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD8BP10966 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD8BP10966 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD8BP10966 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD8BP10966 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD8BP10966 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD8BP10966 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD8BP10966 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD8BP10966 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD8BP10966 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD8BP10966 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CD8BP10966 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD8BP10966 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD8BP10966 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD8BP10966 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD8BP10966 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD8BP10966 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD8BP10966 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD8BP10966 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD8BP10966 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD8BP10966 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD8BP10966 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CD8BP10966 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD8BP10966 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD8BP10966 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD8BP10966 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD8BP10966 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD8BP10966 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD8BP10966 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD8BP10966 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD8BP10966 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD8BP10966 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD8BP10966 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD8BP10966 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD8BP10966 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD8BP10966 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD8BP10966 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD8BP10966 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD8BP10966 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD8BP10966 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD8BP10966 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD8BP10966 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD8BP10966 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD8BP10966 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD8BP10966 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD8BP10966 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD8BP10966 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD8BP10966 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD8BP10966 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD8BP10966 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD8BP10966 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CD8BP10966 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD8BP10966 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CD8BP10966 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms