Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRFP10586 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRFP10586 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRFP10586 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRFP10586 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRFP10586 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRFP10586 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRFP10586 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRFP10586 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRFP10586 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRFP10586 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRFP10586 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRFP10586 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRFP10586 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRFP10586 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRFP10586 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRFP10586 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRFP10586 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRFP10586 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRFP10586 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRFP10586 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRFP10586 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRFP10586 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRFP10586 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRFP10586 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRFP10586 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRFP10586 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRFP10586 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRFP10586 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRFP10586 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRFP10586 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRFP10586 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRFP10586 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRFP10586 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRFP10586 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRFP10586 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRFP10586 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRFP10586 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRFP10586 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRFP10586 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRFP10586 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRFP10586 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRFP10586 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRFP10586 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRFP10586 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRFP10586 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRFP10586 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRFP10586 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRFP10586 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRFP10586 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRFP10586 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRFP10586 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRFP10586 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRFP10586 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRFP10586 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRFP10586 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRFP10586 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRFP10586 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRFP10586 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRFP10586 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRFP10586 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRFP10586 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRFP10586 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRFP10586 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRFP10586 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRFP10586 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRFP10586 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRFP10586 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRFP10586 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRFP10586 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRFP10586 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRFP10586 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRFP10586 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRFP10586 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRFP10586 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRFP10586 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRFP10586 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRFP10586 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRFP10586 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRFP10586 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRFP10586 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRFP10586 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRFP10586 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRFP10586 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRFP10586 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRFP10586 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRFP10586 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRFP10586 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRFP10586 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRFP10586 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRFP10586 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRFP10586 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRFP10586 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRFP10586 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRFP10586 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRFP10586 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRFP10586 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRFP10586 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRFP10586 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRFP10586 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms