Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GLI3P10071 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GLI3P10071 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GLI3P10071 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GLI3P10071 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GLI3P10071 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GLI3P10071 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GLI3P10071 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GLI3P10071 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GLI3P10071 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GLI3P10071 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
GLI3P10071 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GLI3P10071 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GLI3P10071 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GLI3P10071 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GLI3P10071 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GLI3P10071 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GLI3P10071 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GLI3P10071 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
GLI3P10071 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GLI3P10071 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GLI3P10071 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GLI3P10071 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GLI3P10071 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GLI3P10071 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GLI3P10071 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GLI3P10071 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GLI3P10071 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GLI3P10071 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GLI3P10071 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GLI3P10071 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GLI3P10071 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GLI3P10071 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
GLI3P10071 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GLI3P10071 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GLI3P10071 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GLI3P10071 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GLI3P10071 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
GLI3P10071 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GLI3P10071 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GLI3P10071 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GLI3P10071 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GLI3P10071 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GLI3P10071 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GLI3P10071 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
GLI3P10071 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
GLI3P10071 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
GLI3P10071 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
GLI3P10071 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GLI3P10071 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GLI3P10071 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GLI3P10071 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GLI3P10071 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GLI3P10071 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GLI3P10071 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GLI3P10071 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GLI3P10071 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GLI3P10071 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GLI3P10071 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GLI3P10071 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GLI3P10071 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GLI3P10071 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GLI3P10071 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GLI3P10071 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GLI3P10071 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
GLI3P10071 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GLI3P10071 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GLI3P10071 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GLI3P10071 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
GLI3P10071 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
GLI3P10071 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GLI3P10071 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GLI3P10071 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GLI3P10071 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GLI3P10071 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GLI3P10071 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GLI3P10071 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GLI3P10071 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GLI3P10071 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GLI3P10071 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
GLI3P10071 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GLI3P10071 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GLI3P10071 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GLI3P10071 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GLI3P10071 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GLI3P10071 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GLI3P10071 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GLI3P10071 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GLI3P10071 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GLI3P10071 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
GLI3P10071 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GLI3P10071 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GLI3P10071 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
GLI3P10071 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GLI3P10071 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GLI3P10071 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
GLI3P10071 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
GLI3P10071 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GLI3P10071 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GLI3P10071 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms