Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGAVP06756 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGAVP06756 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGAVP06756 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGAVP06756 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGAVP06756 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGAVP06756 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGAVP06756 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGAVP06756 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGAVP06756 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGAVP06756 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGAVP06756 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms