Protein–RNA interactions for Protein: P05014

IFNA4, Interferon alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA4P05014 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFNA4P05014 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFNA4P05014 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFNA4P05014 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFNA4P05014 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFNA4P05014 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFNA4P05014 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFNA4P05014 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFNA4P05014 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFNA4P05014 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
IFNA4P05014 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFNA4P05014 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
IFNA4P05014 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFNA4P05014 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
IFNA4P05014 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFNA4P05014 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFNA4P05014 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFNA4P05014 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFNA4P05014 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IFNA4P05014 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms