Protein–RNA interactions for Protein: P01861

IGHG4, Immunoglobulin heavy constant gamma 4, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHG4P01861 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGHG4P01861 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGHG4P01861 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGHG4P01861 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGHG4P01861 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGHG4P01861 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGHG4P01861 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGHG4P01861 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGHG4P01861 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGHG4P01861 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGHG4P01861 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGHG4P01861 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHG4P01861 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHG4P01861 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHG4P01861 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHG4P01861 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHG4P01861 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHG4P01861 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHG4P01861 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHG4P01861 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHG4P01861 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHG4P01861 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHG4P01861 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHG4P01861 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHG4P01861 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHG4P01861 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHG4P01861 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHG4P01861 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHG4P01861 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHG4P01861 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHG4P01861 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHG4P01861 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHG4P01861 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHG4P01861 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHG4P01861 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHG4P01861 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHG4P01861 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHG4P01861 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHG4P01861 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHG4P01861 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHG4P01861 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHG4P01861 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHG4P01861 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHG4P01861 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHG4P01861 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHG4P01861 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHG4P01861 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHG4P01861 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHG4P01861 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHG4P01861 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHG4P01861 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHG4P01861 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHG4P01861 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHG4P01861 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHG4P01861 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHG4P01861 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHG4P01861 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHG4P01861 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHG4P01861 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHG4P01861 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHG4P01861 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHG4P01861 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHG4P01861 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHG4P01861 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHG4P01861 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHG4P01861 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHG4P01861 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHG4P01861 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHG4P01861 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHG4P01861 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHG4P01861 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHG4P01861 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHG4P01861 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHG4P01861 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHG4P01861 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHG4P01861 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHG4P01861 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHG4P01861 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHG4P01861 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHG4P01861 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHG4P01861 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHG4P01861 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHG4P01861 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHG4P01861 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHG4P01861 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHG4P01861 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHG4P01861 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHG4P01861 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHG4P01861 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHG4P01861 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHG4P01861 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHG4P01861 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHG4P01861 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHG4P01861 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHG4P01861 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHG4P01861 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHG4P01861 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHG4P01861 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHG4P01861 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHG4P01861 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms