Protein–RNA interactions for Protein: O95696

BRD1, Bromodomain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD1O95696 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRD1O95696 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRD1O95696 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRD1O95696 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRD1O95696 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRD1O95696 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRD1O95696 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRD1O95696 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRD1O95696 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRD1O95696 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRD1O95696 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRD1O95696 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRD1O95696 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRD1O95696 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRD1O95696 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
BRD1O95696 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
BRD1O95696 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRD1O95696 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRD1O95696 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRD1O95696 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
BRD1O95696 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
BRD1O95696 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
BRD1O95696 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRD1O95696 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRD1O95696 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRD1O95696 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRD1O95696 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRD1O95696 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRD1O95696 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRD1O95696 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BRD1O95696 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRD1O95696 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRD1O95696 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRD1O95696 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRD1O95696 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRD1O95696 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRD1O95696 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
BRD1O95696 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
BRD1O95696 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRD1O95696 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRD1O95696 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRD1O95696 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRD1O95696 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRD1O95696 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRD1O95696 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRD1O95696 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRD1O95696 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRD1O95696 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRD1O95696 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BRD1O95696 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
BRD1O95696 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRD1O95696 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRD1O95696 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRD1O95696 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRD1O95696 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRD1O95696 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRD1O95696 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRD1O95696 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRD1O95696 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRD1O95696 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRD1O95696 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRD1O95696 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRD1O95696 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRD1O95696 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
BRD1O95696 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BRD1O95696 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRD1O95696 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRD1O95696 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRD1O95696 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRD1O95696 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRD1O95696 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRD1O95696 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRD1O95696 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRD1O95696 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
BRD1O95696 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRD1O95696 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRD1O95696 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRD1O95696 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRD1O95696 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRD1O95696 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRD1O95696 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRD1O95696 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRD1O95696 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRD1O95696 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRD1O95696 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRD1O95696 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRD1O95696 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRD1O95696 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRD1O95696 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRD1O95696 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRD1O95696 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
BRD1O95696 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRD1O95696 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRD1O95696 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRD1O95696 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRD1O95696 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRD1O95696 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRD1O95696 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRD1O95696 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRD1O95696 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms