Protein–RNA interactions for Protein: O60312

ATP10A, Probable phospholipid-transporting ATPase VA, humanhuman

Predictions only

Length 1,499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP10AO60312 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ATP10AO60312 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ATP10AO60312 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ATP10AO60312 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
ATP10AO60312 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ATP10AO60312 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ATP10AO60312 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ATP10AO60312 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ATP10AO60312 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
ATP10AO60312 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
ATP10AO60312 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ATP10AO60312 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ATP10AO60312 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ATP10AO60312 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ATP10AO60312 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ATP10AO60312 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ATP10AO60312 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ATP10AO60312 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ATP10AO60312 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ATP10AO60312 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ATP10AO60312 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ATP10AO60312 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ATP10AO60312 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ATP10AO60312 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ATP10AO60312 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ATP10AO60312 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ATP10AO60312 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
ATP10AO60312 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ATP10AO60312 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ATP10AO60312 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ATP10AO60312 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ATP10AO60312 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ATP10AO60312 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ATP10AO60312 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
ATP10AO60312 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
ATP10AO60312 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ATP10AO60312 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ATP10AO60312 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ATP10AO60312 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
ATP10AO60312 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ATP10AO60312 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ATP10AO60312 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ATP10AO60312 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
ATP10AO60312 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ATP10AO60312 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ATP10AO60312 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ATP10AO60312 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ATP10AO60312 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ATP10AO60312 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ATP10AO60312 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ATP10AO60312 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ATP10AO60312 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ATP10AO60312 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ATP10AO60312 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ATP10AO60312 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ATP10AO60312 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ATP10AO60312 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ATP10AO60312 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ATP10AO60312 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ATP10AO60312 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ATP10AO60312 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ATP10AO60312 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ATP10AO60312 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
ATP10AO60312 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
ATP10AO60312 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ATP10AO60312 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ATP10AO60312 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ATP10AO60312 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
ATP10AO60312 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ATP10AO60312 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ATP10AO60312 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ATP10AO60312 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ATP10AO60312 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ATP10AO60312 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ATP10AO60312 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ATP10AO60312 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ATP10AO60312 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ATP10AO60312 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ATP10AO60312 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ATP10AO60312 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ATP10AO60312 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ATP10AO60312 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ATP10AO60312 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ATP10AO60312 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ATP10AO60312 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ATP10AO60312 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ATP10AO60312 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ATP10AO60312 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ATP10AO60312 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ATP10AO60312 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ATP10AO60312 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ATP10AO60312 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ATP10AO60312 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ATP10AO60312 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
ATP10AO60312 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
ATP10AO60312 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
ATP10AO60312 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
ATP10AO60312 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ATP10AO60312 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ATP10AO60312 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms