Protein–RNA interactions for Protein: O43633

CHMP2A, Charged multivesicular body protein 2a, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP2AO43633 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CHMP2AO43633 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP2AO43633 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP2AO43633 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP2AO43633 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP2AO43633 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP2AO43633 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP2AO43633 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP2AO43633 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP2AO43633 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP2AO43633 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP2AO43633 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP2AO43633 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP2AO43633 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP2AO43633 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP2AO43633 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP2AO43633 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP2AO43633 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP2AO43633 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP2AO43633 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP2AO43633 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP2AO43633 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP2AO43633 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP2AO43633 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP2AO43633 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHMP2AO43633 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHMP2AO43633 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHMP2AO43633 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHMP2AO43633 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHMP2AO43633 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHMP2AO43633 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHMP2AO43633 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHMP2AO43633 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHMP2AO43633 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHMP2AO43633 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHMP2AO43633 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHMP2AO43633 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHMP2AO43633 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHMP2AO43633 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHMP2AO43633 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHMP2AO43633 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP2AO43633 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP2AO43633 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP2AO43633 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP2AO43633 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP2AO43633 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP2AO43633 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP2AO43633 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP2AO43633 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP2AO43633 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP2AO43633 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP2AO43633 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP2AO43633 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP2AO43633 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP2AO43633 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP2AO43633 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP2AO43633 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP2AO43633 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP2AO43633 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP2AO43633 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP2AO43633 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP2AO43633 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP2AO43633 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP2AO43633 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP2AO43633 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP2AO43633 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP2AO43633 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP2AO43633 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP2AO43633 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP2AO43633 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP2AO43633 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP2AO43633 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP2AO43633 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP2AO43633 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP2AO43633 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP2AO43633 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP2AO43633 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP2AO43633 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP2AO43633 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP2AO43633 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP2AO43633 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP2AO43633 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP2AO43633 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP2AO43633 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP2AO43633 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP2AO43633 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP2AO43633 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP2AO43633 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP2AO43633 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP2AO43633 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP2AO43633 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP2AO43633 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP2AO43633 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP2AO43633 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP2AO43633 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP2AO43633 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP2AO43633 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP2AO43633 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP2AO43633 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP2AO43633 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms