Protein–RNA interactions for Protein: O43295

SRGAP3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP3O43295 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRGAP3O43295 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRGAP3O43295 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRGAP3O43295 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRGAP3O43295 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRGAP3O43295 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRGAP3O43295 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRGAP3O43295 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRGAP3O43295 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRGAP3O43295 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRGAP3O43295 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRGAP3O43295 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRGAP3O43295 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRGAP3O43295 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRGAP3O43295 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRGAP3O43295 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRGAP3O43295 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRGAP3O43295 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRGAP3O43295 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRGAP3O43295 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRGAP3O43295 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRGAP3O43295 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRGAP3O43295 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRGAP3O43295 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRGAP3O43295 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRGAP3O43295 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRGAP3O43295 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRGAP3O43295 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRGAP3O43295 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRGAP3O43295 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRGAP3O43295 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRGAP3O43295 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRGAP3O43295 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRGAP3O43295 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRGAP3O43295 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRGAP3O43295 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRGAP3O43295 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRGAP3O43295 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRGAP3O43295 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRGAP3O43295 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRGAP3O43295 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRGAP3O43295 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRGAP3O43295 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRGAP3O43295 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRGAP3O43295 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRGAP3O43295 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRGAP3O43295 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRGAP3O43295 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRGAP3O43295 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRGAP3O43295 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRGAP3O43295 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRGAP3O43295 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRGAP3O43295 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRGAP3O43295 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRGAP3O43295 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRGAP3O43295 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRGAP3O43295 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRGAP3O43295 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRGAP3O43295 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRGAP3O43295 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRGAP3O43295 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRGAP3O43295 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRGAP3O43295 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRGAP3O43295 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRGAP3O43295 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRGAP3O43295 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRGAP3O43295 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRGAP3O43295 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRGAP3O43295 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SRGAP3O43295 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRGAP3O43295 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRGAP3O43295 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRGAP3O43295 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRGAP3O43295 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRGAP3O43295 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRGAP3O43295 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SRGAP3O43295 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRGAP3O43295 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRGAP3O43295 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRGAP3O43295 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRGAP3O43295 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRGAP3O43295 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRGAP3O43295 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRGAP3O43295 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRGAP3O43295 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRGAP3O43295 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SRGAP3O43295 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRGAP3O43295 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRGAP3O43295 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRGAP3O43295 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRGAP3O43295 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRGAP3O43295 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRGAP3O43295 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRGAP3O43295 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRGAP3O43295 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRGAP3O43295 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRGAP3O43295 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRGAP3O43295 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRGAP3O43295 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRGAP3O43295 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms