Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SYNMO15061 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SYNMO15061 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
SYNMO15061 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SYNMO15061 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SYNMO15061 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SYNMO15061 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SYNMO15061 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
SYNMO15061 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SYNMO15061 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SYNMO15061 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SYNMO15061 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SYNMO15061 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SYNMO15061 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SYNMO15061 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SYNMO15061 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SYNMO15061 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SYNMO15061 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
SYNMO15061 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SYNMO15061 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
SYNMO15061 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SYNMO15061 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SYNMO15061 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SYNMO15061 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SYNMO15061 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SYNMO15061 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
SYNMO15061 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SYNMO15061 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SYNMO15061 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SYNMO15061 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SYNMO15061 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SYNMO15061 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SYNMO15061 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SYNMO15061 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SYNMO15061 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SYNMO15061 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SYNMO15061 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SYNMO15061 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SYNMO15061 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SYNMO15061 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SYNMO15061 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SYNMO15061 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SYNMO15061 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SYNMO15061 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SYNMO15061 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SYNMO15061 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SYNMO15061 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SYNMO15061 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SYNMO15061 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SYNMO15061 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SYNMO15061 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SYNMO15061 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
SYNMO15061 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SYNMO15061 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SYNMO15061 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SYNMO15061 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SYNMO15061 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SYNMO15061 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SYNMO15061 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SYNMO15061 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SYNMO15061 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SYNMO15061 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
SYNMO15061 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
SYNMO15061 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SYNMO15061 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
SYNMO15061 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SYNMO15061 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SYNMO15061 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SYNMO15061 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SYNMO15061 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SYNMO15061 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SYNMO15061 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SYNMO15061 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SYNMO15061 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SYNMO15061 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SYNMO15061 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SYNMO15061 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
SYNMO15061 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SYNMO15061 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
SYNMO15061 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SYNMO15061 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SYNMO15061 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SYNMO15061 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SYNMO15061 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SYNMO15061 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SYNMO15061 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SYNMO15061 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SYNMO15061 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SYNMO15061 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SYNMO15061 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SYNMO15061 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SYNMO15061 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SYNMO15061 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SYNMO15061 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SYNMO15061 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SYNMO15061 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SYNMO15061 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SYNMO15061 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SYNMO15061 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SYNMO15061 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms