Protein–RNA interactions for Protein: O00329

PIK3CD, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CDO00329 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PIK3CDO00329 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIK3CDO00329 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIK3CDO00329 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIK3CDO00329 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PIK3CDO00329 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIK3CDO00329 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PIK3CDO00329 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PIK3CDO00329 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PIK3CDO00329 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PIK3CDO00329 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PIK3CDO00329 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PIK3CDO00329 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PIK3CDO00329 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PIK3CDO00329 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PIK3CDO00329 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PIK3CDO00329 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PIK3CDO00329 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PIK3CDO00329 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PIK3CDO00329 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PIK3CDO00329 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PIK3CDO00329 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIK3CDO00329 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIK3CDO00329 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PIK3CDO00329 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIK3CDO00329 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIK3CDO00329 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIK3CDO00329 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIK3CDO00329 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIK3CDO00329 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIK3CDO00329 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIK3CDO00329 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIK3CDO00329 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIK3CDO00329 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIK3CDO00329 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIK3CDO00329 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIK3CDO00329 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIK3CDO00329 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIK3CDO00329 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PIK3CDO00329 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PIK3CDO00329 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PIK3CDO00329 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PIK3CDO00329 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PIK3CDO00329 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PIK3CDO00329 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PIK3CDO00329 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PIK3CDO00329 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PIK3CDO00329 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PIK3CDO00329 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PIK3CDO00329 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIK3CDO00329 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIK3CDO00329 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIK3CDO00329 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIK3CDO00329 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIK3CDO00329 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIK3CDO00329 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIK3CDO00329 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIK3CDO00329 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIK3CDO00329 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIK3CDO00329 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIK3CDO00329 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIK3CDO00329 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIK3CDO00329 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIK3CDO00329 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIK3CDO00329 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIK3CDO00329 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIK3CDO00329 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIK3CDO00329 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIK3CDO00329 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIK3CDO00329 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIK3CDO00329 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIK3CDO00329 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIK3CDO00329 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIK3CDO00329 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PIK3CDO00329 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PIK3CDO00329 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PIK3CDO00329 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PIK3CDO00329 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PIK3CDO00329 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PIK3CDO00329 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PIK3CDO00329 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PIK3CDO00329 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PIK3CDO00329 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PIK3CDO00329 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PIK3CDO00329 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PIK3CDO00329 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PIK3CDO00329 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PIK3CDO00329 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PIK3CDO00329 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PIK3CDO00329 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIK3CDO00329 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIK3CDO00329 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIK3CDO00329 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIK3CDO00329 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIK3CDO00329 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIK3CDO00329 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIK3CDO00329 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PIK3CDO00329 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIK3CDO00329 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIK3CDO00329 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms