Protein–RNA interactions for Protein: O00221

NFKBIE, NF-kappa-B inhibitor epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIEO00221 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NFKBIEO00221 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NFKBIEO00221 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NFKBIEO00221 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NFKBIEO00221 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NFKBIEO00221 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NFKBIEO00221 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NFKBIEO00221 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NFKBIEO00221 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NFKBIEO00221 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NFKBIEO00221 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NFKBIEO00221 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NFKBIEO00221 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NFKBIEO00221 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NFKBIEO00221 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NFKBIEO00221 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NFKBIEO00221 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NFKBIEO00221 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NFKBIEO00221 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NFKBIEO00221 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NFKBIEO00221 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NFKBIEO00221 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NFKBIEO00221 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NFKBIEO00221 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NFKBIEO00221 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NFKBIEO00221 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NFKBIEO00221 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NFKBIEO00221 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NFKBIEO00221 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NFKBIEO00221 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NFKBIEO00221 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NFKBIEO00221 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NFKBIEO00221 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NFKBIEO00221 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NFKBIEO00221 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NFKBIEO00221 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NFKBIEO00221 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NFKBIEO00221 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NFKBIEO00221 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NFKBIEO00221 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NFKBIEO00221 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NFKBIEO00221 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFKBIEO00221 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFKBIEO00221 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFKBIEO00221 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFKBIEO00221 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFKBIEO00221 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFKBIEO00221 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFKBIEO00221 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFKBIEO00221 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFKBIEO00221 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFKBIEO00221 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFKBIEO00221 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFKBIEO00221 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFKBIEO00221 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFKBIEO00221 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFKBIEO00221 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFKBIEO00221 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFKBIEO00221 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFKBIEO00221 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NFKBIEO00221 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NFKBIEO00221 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NFKBIEO00221 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NFKBIEO00221 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NFKBIEO00221 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
NFKBIEO00221 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NFKBIEO00221 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NFKBIEO00221 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NFKBIEO00221 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
NFKBIEO00221 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NFKBIEO00221 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NFKBIEO00221 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NFKBIEO00221 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
NFKBIEO00221 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NFKBIEO00221 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NFKBIEO00221 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NFKBIEO00221 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NFKBIEO00221 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NFKBIEO00221 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NFKBIEO00221 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NFKBIEO00221 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NFKBIEO00221 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NFKBIEO00221 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NFKBIEO00221 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NFKBIEO00221 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NFKBIEO00221 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NFKBIEO00221 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NFKBIEO00221 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NFKBIEO00221 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NFKBIEO00221 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NFKBIEO00221 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NFKBIEO00221 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NFKBIEO00221 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NFKBIEO00221 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NFKBIEO00221 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NFKBIEO00221 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NFKBIEO00221 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NFKBIEO00221 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NFKBIEO00221 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NFKBIEO00221 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms