Protein–RNA interactions for Protein: D6RBQ6

USP17L17, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L17D6RBQ6 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP17L17D6RBQ6 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP17L17D6RBQ6 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
USP17L17D6RBQ6 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP17L17D6RBQ6 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP17L17D6RBQ6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP17L17D6RBQ6 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP17L17D6RBQ6 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP17L17D6RBQ6 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP17L17D6RBQ6 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP17L17D6RBQ6 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP17L17D6RBQ6 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP17L17D6RBQ6 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP17L17D6RBQ6 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP17L17D6RBQ6 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP17L17D6RBQ6 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
USP17L17D6RBQ6 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP17L17D6RBQ6 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
USP17L17D6RBQ6 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP17L17D6RBQ6 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP17L17D6RBQ6 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP17L17D6RBQ6 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP17L17D6RBQ6 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP17L17D6RBQ6 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP17L17D6RBQ6 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP17L17D6RBQ6 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP17L17D6RBQ6 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP17L17D6RBQ6 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP17L17D6RBQ6 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP17L17D6RBQ6 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP17L17D6RBQ6 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP17L17D6RBQ6 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP17L17D6RBQ6 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP17L17D6RBQ6 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP17L17D6RBQ6 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
USP17L17D6RBQ6 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP17L17D6RBQ6 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP17L17D6RBQ6 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP17L17D6RBQ6 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
USP17L17D6RBQ6 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
USP17L17D6RBQ6 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP17L17D6RBQ6 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
USP17L17D6RBQ6 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP17L17D6RBQ6 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP17L17D6RBQ6 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP17L17D6RBQ6 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP17L17D6RBQ6 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP17L17D6RBQ6 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP17L17D6RBQ6 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
USP17L17D6RBQ6 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP17L17D6RBQ6 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP17L17D6RBQ6 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP17L17D6RBQ6 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP17L17D6RBQ6 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP17L17D6RBQ6 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
USP17L17D6RBQ6 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP17L17D6RBQ6 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP17L17D6RBQ6 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP17L17D6RBQ6 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP17L17D6RBQ6 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
USP17L17D6RBQ6 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
USP17L17D6RBQ6 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP17L17D6RBQ6 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP17L17D6RBQ6 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
USP17L17D6RBQ6 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP17L17D6RBQ6 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP17L17D6RBQ6 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP17L17D6RBQ6 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP17L17D6RBQ6 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
USP17L17D6RBQ6 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP17L17D6RBQ6 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP17L17D6RBQ6 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP17L17D6RBQ6 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP17L17D6RBQ6 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP17L17D6RBQ6 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP17L17D6RBQ6 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP17L17D6RBQ6 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP17L17D6RBQ6 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP17L17D6RBQ6 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP17L17D6RBQ6 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP17L17D6RBQ6 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP17L17D6RBQ6 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP17L17D6RBQ6 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP17L17D6RBQ6 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP17L17D6RBQ6 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
USP17L17D6RBQ6 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP17L17D6RBQ6 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP17L17D6RBQ6 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP17L17D6RBQ6 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP17L17D6RBQ6 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
USP17L17D6RBQ6 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
USP17L17D6RBQ6 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP17L17D6RBQ6 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
USP17L17D6RBQ6 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP17L17D6RBQ6 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP17L17D6RBQ6 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP17L17D6RBQ6 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP17L17D6RBQ6 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L17D6RBQ6 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L17D6RBQ6 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms