Protein–RNA interactions for Protein: C9JVI0

USP17L11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L11C9JVI0 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP17L11C9JVI0 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP17L11C9JVI0 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
USP17L11C9JVI0 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP17L11C9JVI0 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP17L11C9JVI0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP17L11C9JVI0 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP17L11C9JVI0 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP17L11C9JVI0 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP17L11C9JVI0 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP17L11C9JVI0 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP17L11C9JVI0 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP17L11C9JVI0 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP17L11C9JVI0 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP17L11C9JVI0 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP17L11C9JVI0 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
USP17L11C9JVI0 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP17L11C9JVI0 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
USP17L11C9JVI0 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP17L11C9JVI0 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP17L11C9JVI0 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP17L11C9JVI0 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP17L11C9JVI0 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP17L11C9JVI0 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP17L11C9JVI0 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP17L11C9JVI0 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP17L11C9JVI0 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP17L11C9JVI0 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP17L11C9JVI0 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP17L11C9JVI0 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP17L11C9JVI0 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP17L11C9JVI0 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP17L11C9JVI0 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP17L11C9JVI0 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP17L11C9JVI0 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
USP17L11C9JVI0 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP17L11C9JVI0 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP17L11C9JVI0 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP17L11C9JVI0 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
USP17L11C9JVI0 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
USP17L11C9JVI0 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP17L11C9JVI0 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
USP17L11C9JVI0 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP17L11C9JVI0 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP17L11C9JVI0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP17L11C9JVI0 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP17L11C9JVI0 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP17L11C9JVI0 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP17L11C9JVI0 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
USP17L11C9JVI0 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP17L11C9JVI0 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP17L11C9JVI0 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP17L11C9JVI0 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP17L11C9JVI0 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP17L11C9JVI0 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
USP17L11C9JVI0 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP17L11C9JVI0 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP17L11C9JVI0 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP17L11C9JVI0 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP17L11C9JVI0 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
USP17L11C9JVI0 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
USP17L11C9JVI0 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP17L11C9JVI0 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP17L11C9JVI0 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
USP17L11C9JVI0 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP17L11C9JVI0 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP17L11C9JVI0 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP17L11C9JVI0 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP17L11C9JVI0 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
USP17L11C9JVI0 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP17L11C9JVI0 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP17L11C9JVI0 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP17L11C9JVI0 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP17L11C9JVI0 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP17L11C9JVI0 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP17L11C9JVI0 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP17L11C9JVI0 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP17L11C9JVI0 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP17L11C9JVI0 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP17L11C9JVI0 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP17L11C9JVI0 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP17L11C9JVI0 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP17L11C9JVI0 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP17L11C9JVI0 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP17L11C9JVI0 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
USP17L11C9JVI0 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP17L11C9JVI0 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP17L11C9JVI0 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP17L11C9JVI0 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP17L11C9JVI0 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
USP17L11C9JVI0 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
USP17L11C9JVI0 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP17L11C9JVI0 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
USP17L11C9JVI0 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP17L11C9JVI0 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP17L11C9JVI0 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP17L11C9JVI0 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP17L11C9JVI0 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L11C9JVI0 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L11C9JVI0 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms