Protein–RNA interactions for Protein: B7ZW38

HNRNPCL3, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein C-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPCL3B7ZW38 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HNRNPCL3B7ZW38 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HNRNPCL3B7ZW38 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HNRNPCL3B7ZW38 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HNRNPCL3B7ZW38 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HNRNPCL3B7ZW38 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HNRNPCL3B7ZW38 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HNRNPCL3B7ZW38 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HNRNPCL3B7ZW38 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HNRNPCL3B7ZW38 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HNRNPCL3B7ZW38 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HNRNPCL3B7ZW38 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HNRNPCL3B7ZW38 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HNRNPCL3B7ZW38 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HNRNPCL3B7ZW38 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HNRNPCL3B7ZW38 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HNRNPCL3B7ZW38 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HNRNPCL3B7ZW38 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HNRNPCL3B7ZW38 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HNRNPCL3B7ZW38 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HNRNPCL3B7ZW38 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HNRNPCL3B7ZW38 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HNRNPCL3B7ZW38 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HNRNPCL3B7ZW38 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HNRNPCL3B7ZW38 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HNRNPCL3B7ZW38 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HNRNPCL3B7ZW38 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HNRNPCL3B7ZW38 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HNRNPCL3B7ZW38 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HNRNPCL3B7ZW38 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HNRNPCL3B7ZW38 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HNRNPCL3B7ZW38 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HNRNPCL3B7ZW38 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HNRNPCL3B7ZW38 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HNRNPCL3B7ZW38 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HNRNPCL3B7ZW38 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HNRNPCL3B7ZW38 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HNRNPCL3B7ZW38 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HNRNPCL3B7ZW38 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HNRNPCL3B7ZW38 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HNRNPCL3B7ZW38 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HNRNPCL3B7ZW38 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HNRNPCL3B7ZW38 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HNRNPCL3B7ZW38 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HNRNPCL3B7ZW38 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HNRNPCL3B7ZW38 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HNRNPCL3B7ZW38 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HNRNPCL3B7ZW38 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HNRNPCL3B7ZW38 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HNRNPCL3B7ZW38 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HNRNPCL3B7ZW38 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HNRNPCL3B7ZW38 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HNRNPCL3B7ZW38 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HNRNPCL3B7ZW38 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HNRNPCL3B7ZW38 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HNRNPCL3B7ZW38 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HNRNPCL3B7ZW38 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HNRNPCL3B7ZW38 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HNRNPCL3B7ZW38 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HNRNPCL3B7ZW38 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HNRNPCL3B7ZW38 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HNRNPCL3B7ZW38 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HNRNPCL3B7ZW38 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HNRNPCL3B7ZW38 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HNRNPCL3B7ZW38 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HNRNPCL3B7ZW38 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HNRNPCL3B7ZW38 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HNRNPCL3B7ZW38 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HNRNPCL3B7ZW38 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HNRNPCL3B7ZW38 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HNRNPCL3B7ZW38 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HNRNPCL3B7ZW38 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HNRNPCL3B7ZW38 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HNRNPCL3B7ZW38 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HNRNPCL3B7ZW38 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HNRNPCL3B7ZW38 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HNRNPCL3B7ZW38 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HNRNPCL3B7ZW38 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HNRNPCL3B7ZW38 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HNRNPCL3B7ZW38 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HNRNPCL3B7ZW38 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HNRNPCL3B7ZW38 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HNRNPCL3B7ZW38 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HNRNPCL3B7ZW38 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HNRNPCL3B7ZW38 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HNRNPCL3B7ZW38 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HNRNPCL3B7ZW38 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HNRNPCL3B7ZW38 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HNRNPCL3B7ZW38 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HNRNPCL3B7ZW38 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HNRNPCL3B7ZW38 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HNRNPCL3B7ZW38 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HNRNPCL3B7ZW38 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HNRNPCL3B7ZW38 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HNRNPCL3B7ZW38 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HNRNPCL3B7ZW38 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HNRNPCL3B7ZW38 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
HNRNPCL3B7ZW38 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HNRNPCL3B7ZW38 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HNRNPCL3B7ZW38 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms