Protein–RNA interactions for Protein: A4D0S4

LAMB4, Laminin subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB4A4D0S4 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LAMB4A4D0S4 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LAMB4A4D0S4 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LAMB4A4D0S4 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
LAMB4A4D0S4 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LAMB4A4D0S4 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LAMB4A4D0S4 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LAMB4A4D0S4 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LAMB4A4D0S4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LAMB4A4D0S4 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LAMB4A4D0S4 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LAMB4A4D0S4 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LAMB4A4D0S4 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LAMB4A4D0S4 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LAMB4A4D0S4 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LAMB4A4D0S4 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LAMB4A4D0S4 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
LAMB4A4D0S4 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LAMB4A4D0S4 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LAMB4A4D0S4 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LAMB4A4D0S4 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LAMB4A4D0S4 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LAMB4A4D0S4 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LAMB4A4D0S4 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LAMB4A4D0S4 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LAMB4A4D0S4 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LAMB4A4D0S4 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LAMB4A4D0S4 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LAMB4A4D0S4 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LAMB4A4D0S4 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LAMB4A4D0S4 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LAMB4A4D0S4 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LAMB4A4D0S4 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LAMB4A4D0S4 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LAMB4A4D0S4 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LAMB4A4D0S4 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
LAMB4A4D0S4 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LAMB4A4D0S4 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LAMB4A4D0S4 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LAMB4A4D0S4 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LAMB4A4D0S4 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LAMB4A4D0S4 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LAMB4A4D0S4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LAMB4A4D0S4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LAMB4A4D0S4 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LAMB4A4D0S4 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LAMB4A4D0S4 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LAMB4A4D0S4 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LAMB4A4D0S4 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
LAMB4A4D0S4 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
LAMB4A4D0S4 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LAMB4A4D0S4 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
LAMB4A4D0S4 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LAMB4A4D0S4 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LAMB4A4D0S4 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LAMB4A4D0S4 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LAMB4A4D0S4 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LAMB4A4D0S4 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LAMB4A4D0S4 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LAMB4A4D0S4 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LAMB4A4D0S4 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LAMB4A4D0S4 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LAMB4A4D0S4 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LAMB4A4D0S4 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LAMB4A4D0S4 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LAMB4A4D0S4 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LAMB4A4D0S4 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC25■■□□□ 1.59
LAMB4A4D0S4 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
LAMB4A4D0S4 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
LAMB4A4D0S4 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LAMB4A4D0S4 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LAMB4A4D0S4 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LAMB4A4D0S4 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LAMB4A4D0S4 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LAMB4A4D0S4 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LAMB4A4D0S4 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LAMB4A4D0S4 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LAMB4A4D0S4 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LAMB4A4D0S4 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LAMB4A4D0S4 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LAMB4A4D0S4 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
LAMB4A4D0S4 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
LAMB4A4D0S4 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LAMB4A4D0S4 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LAMB4A4D0S4 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LAMB4A4D0S4 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LAMB4A4D0S4 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LAMB4A4D0S4 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LAMB4A4D0S4 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LAMB4A4D0S4 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LAMB4A4D0S4 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LAMB4A4D0S4 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LAMB4A4D0S4 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LAMB4A4D0S4 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LAMB4A4D0S4 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LAMB4A4D0S4 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LAMB4A4D0S4 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LAMB4A4D0S4 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
LAMB4A4D0S4 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LAMB4A4D0S4 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms