Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPDC1A2A3K4 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPDC1A2A3K4 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPDC1A2A3K4 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPDC1A2A3K4 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPDC1A2A3K4 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPDC1A2A3K4 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPDC1A2A3K4 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPDC1A2A3K4 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPDC1A2A3K4 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPDC1A2A3K4 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPDC1A2A3K4 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPDC1A2A3K4 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms