Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 GNRHR-202ENST00000420975 859 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 SLC6A13-202ENST00000436453 1101 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 AMYP1-201ENST00000440059 1023 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 NPM1P19-201ENST00000450070 712 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 AC136489.1-203ENST00000450246 736 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
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USP18Q9UMW8 snoU109.3-201ENST00000459477 145 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
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USP18Q9UMW8 AC008429.2-201ENST00000523057 864 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
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USP18Q9UMW8 AC109309.2-201ENST00000612597 332 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
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USP18Q9UMW8 Metazoa_SRP.66-201ENST00000615609 282 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 AC004801.6-201ENST00000616571 978 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
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USP18Q9UMW8 AP001264.1-201ENST00000620602 703 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 LINC00598-209ENST00000635966 1148 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
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USP18Q9UMW8 CHCHD7-203ENST00000396723 1550 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 AC084816.1-210ENST00000540895 1920 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 RBM28-201ENST00000223073 15507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 RARB-204ENST00000458646 2590 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 ZNF211-205ENST00000391703 2239 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 CLEC12A-201ENST00000304361 1549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 DSC1-202ENST00000257198 4225 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 QRSL1-202ENST00000369046 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 PDE4B-207ENST00000480109 2037 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 LTA4H-209ENST00000552789 2025 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 GALNT5-201ENST00000259056 6171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
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USP18Q9UMW8 OR51C1P-201ENST00000608504 942 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 MIR6798-201ENST00000612887 67 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 KLRC2-206ENST00000619500 883 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 CSDE1-203ENST00000358528 4076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 ZFX-202ENST00000338565 2906 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 TGIF1-211ENST00000548489 1536 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 YES1-203ENST00000577961 4554 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 AC006213.6-201ENST00000623722 4179 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 BBOX1-205ENST00000529202 1725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
USP18Q9UMW8 AC074141.1-201ENST00000588129 2995 ntBASIC6.84□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 DNAH2-201ENST00000389173 13505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 KAT14-201ENST00000377681 3483 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 ZNF528-201ENST00000360465 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 ZNF490-201ENST00000311437 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 EXD1-202ENST00000458580 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 EIF4A2-205ENST00000440191 1889 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 AL627309.5-201ENST00000484859 4860 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 HEPH-206ENST00000441993 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 AC105105.2-201ENST00000590797 4521 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 CPEB4-202ENST00000334035 6705 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 AC044839.1-206ENST00000635559 1324 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 SLCO1C1-207ENST00000540354 2529 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 ERG-202ENST00000398897 4651 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 HCG18-239ENST00000454129 4433 ntTSL 4 BASIC6.83□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 ZNF92-201ENST00000328747 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
USP18Q9UMW8 ATMIN-204ENST00000564241 4803 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
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