Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 AL008582.1-201ENST00000609612 442 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 AC087683.2-201ENST00000611384 326 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 AC239809.3-208ENST00000611452 531 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 AC068787.1-201ENST00000623908 691 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 AC068057.2-201ENST00000624047 895 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 CLUHP10-201ENST00000631979 980 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 LGALS17A-201ENST00000412609 2562 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 ZNF615-204ENST00000594083 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 TRPC4-204ENST00000379673 2760 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 NDRG3-202ENST00000359675 2917 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 TPMT-201ENST00000309983 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 CDK14-206ENST00000436577 4787 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 HSPD1P8-201ENST00000400121 1658 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 CUL1-204ENST00000617797 2508 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 FP236241.1-201ENST00000623374 7632 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 CU633967.1-211ENST00000624444 7628 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 AC110373.1-201ENST00000505994 3505 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 DCTN5-201ENST00000300087 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 LINC01375-201ENST00000428485 1860 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 AF121898.1-201ENST00000440763 1860 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 KCNJ2-201ENST00000243457 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 FAM216B-202ENST00000537894 3300 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.13□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 GTDC1-207ENST00000409298 2209 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 FOPNL-201ENST00000255759 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 FLRT3-202ENST00000378053 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 SETX-201ENST00000224140 11100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 LNPK-212ENST00000544803 7647 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 MIR421-201ENST00000365696 85 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 CCL20-202ENST00000409189 839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 UBE2F-204ENST00000409953 924 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 RNA5SP155-201ENST00000411154 129 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 MTCO2P8-201ENST00000412213 658 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 BMS1P13-201ENST00000417301 885 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 AC245884.2-201ENST00000426257 404 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 RPL34P27-201ENST00000428810 349 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 RRM2P4-201ENST00000441721 562 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 XKRY2-201ENST00000442362 1093 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 NPM1P9-201ENST00000453156 844 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 AC022415.1-202ENST00000486612 523 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 AC090543.1-201ENST00000492168 485 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 PRELID3BP6-201ENST00000503839 571 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 GOLGA5P1-201ENST00000507317 980 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 SNORA76.2-201ENST00000517095 137 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 IGKV1D-22-201ENST00000518953 324 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 CHCHD7-209ENST00000519367 442 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 AC022973.3-201ENST00000521014 467 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 AC104115.2-201ENST00000523026 687 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 AP002833.2-201ENST00000531585 462 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 OSBPL9P3-201ENST00000534523 595 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 AC139103.1-201ENST00000534696 1030 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 AC005000.1-201ENST00000536192 288 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 PIWIL4-203ENST00000537419 831 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 AC073916.1-201ENST00000545095 130 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 APAF1-211ENST00000552268 1143 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 AP3S2-214ENST00000560940 519 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 AC007496.2-201ENST00000564801 547 ntTSL 4 BASIC6.13□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 AC092718.4-201ENST00000566639 716 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 AC005291.1-201ENST00000577743 641 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 RPL29P33-201ENST00000587474 316 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 AC004805.3-201ENST00000603178 310 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 AL390877.1-201ENST00000605704 214 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 AC097065.2-201ENST00000608159 533 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 MRPL57P1-201ENST00000621486 265 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 AC068880.4-201ENST00000623082 495 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 SNHG5-219ENST00000623910 631 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 AC009039.2-201ENST00000624524 529 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 EPS15-203ENST00000371733 5225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 SLC16A4-201ENST00000369779 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 MMP13-201ENST00000260302 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 SNX13-213ENST00000611725 6817 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 AC009501.3-201ENST00000605001 1352 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 NAT1-208ENST00000520546 1446 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 FSCB-201ENST00000340446 2938 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 FAM83B-201ENST00000306858 3167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 IQCA1-202ENST00000309507 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 ALB-220ENST00000621628 1606 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 PRG4-204ENST00000445192 5044 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 CAPRIN2-203ENST00000417045 3535 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 AP002004.1-201ENST00000532510 3530 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 BABAM2-206ENST00000379632 1752 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 ZNF480-201ENST00000334564 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 SP110-204ENST00000392048 1937 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 MPHOSPH9-220ENST00000606320 6351 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 CX3CR1-201ENST00000358309 3151 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 RCAN2-201ENST00000306764 3240 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 TYW3-203ENST00000457880 3335 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 ZNF449-201ENST00000339249 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 SMG1P5-202ENST00000529428 4219 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 SMG1P2-201ENST00000566127 4221 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 CDC16-202ENST00000252458 1991 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 OR11H1-201ENST00000252835 982 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 MDM2-201ENST00000258148 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 DNM1L-201ENST00000266481 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 OR8K5-201ENST00000313447 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 FASLG-201ENST00000340030 917 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 ACPP-202ENST00000351273 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 U3.52-201ENST00000384034 216 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 AC087276.2-201ENST00000394183 183 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 GTF2IP5-201ENST00000414608 731 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
EHD3Q9NZN3 RAD23B-202ENST00000416373 3835 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.9 ms