Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 FAM13A-AS1-202ENST00000511543 2453 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 FZD3-204ENST00000537916 13740 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AC107980.1-201ENST00000558671 3355 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 EIF4E2-207ENST00000409514 3525 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 ZC3H11B-202ENST00000636126 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 LRP4-AS1-201ENST00000502049 1504 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 HNRNPA1-204ENST00000547276 1539 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF211-202ENST00000254182 1959 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 UBE2V1-202ENST00000371657 1973 ntTSL 4 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF33A-208ENST00000628825 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AC011592.1-201ENST00000624647 3634 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 GAS1RR-201ENST00000415801 4387 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 CACNB4-269ENST00000638005 4615 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 TPD52-203ENST00000448733 4339 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02208-201ENST00000506769 2803 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 MLH3-201ENST00000355774 7896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AC092646.2-201ENST00000431242 2095 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 RAB14-201ENST00000373840 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 CCDC162P-202ENST00000368966 6751 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 MORC3-201ENST00000400485 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 FMO5-202ENST00000369272 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 CACNB4-254ENST00000637514 1880 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 HMGXB4-201ENST00000216106 4047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 BCL9P1-201ENST00000506012 2561 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 PTK2-240ENST00000522684 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AC011525.1-201ENST00000562167 5676 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 MYL6-201ENST00000293422 664 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 PPIH-201ENST00000304979 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 OR1J4-201ENST00000340750 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 ATP2B4-201ENST00000341360 4658 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 FAM177B-201ENST00000360827 764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 UTS2-202ENST00000361696 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 LY6G6D-223ENST00000375825 402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 CSNK2B-202ENST00000375866 936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 LST1-211ENST00000376110 433 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 CBWD1-207ENST00000382447 1241 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AL590143.1-201ENST00000405071 138 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 RPL26P37-201ENST00000411983 438 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AC009228.1-201ENST00000413254 240 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AC008155.1-201ENST00000421078 329 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AC009237.2-201ENST00000421358 284 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 TRBV10-2-201ENST00000426318 395 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 NANOGP4-201ENST00000427230 913 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 ANKRD54P1-201ENST00000433115 471 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 OR5M13P-201ENST00000433944 937 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AP006216.1-201ENST00000439104 419 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AL450263.2-201ENST00000439400 589 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AC092170.1-201ENST00000440211 356 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AP002856.4-201ENST00000441638 569 ntTSL 4 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AL353898.1-201ENST00000444055 238 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 CD59-206ENST00000445143 825 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 RBMY3AP-201ENST00000449381 1145 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 RPS27AP2-201ENST00000457576 465 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 EIF4A2P4-201ENST00000458691 1196 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SL74P-201ENST00000464966 299 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 ARHGEF3-AS1-201ENST00000477246 489 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AC079841.1-201ENST00000481228 950 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SL241P-201ENST00000482973 236 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AC027607.1-201ENST00000503034 534 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 PDLIM1P4-201ENST00000504327 1006 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AC243972.1-201ENST00000542992 570 ntTSL 4 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AC055736.1-201ENST00000548135 629 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AL160314.2-202ENST00000553792 534 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AC090971.3-201ENST00000557871 1041 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AC027808.2-203ENST00000558261 638 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 RPLP1-205ENST00000560274 256 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AC034105.2-201ENST00000561866 238 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AL133457.1-201ENST00000564251 987 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AC092287.1-201ENST00000565782 463 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AC010547.7-201ENST00000570323 333 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 USP2-AS1-205ENST00000578923 895 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 SNRPCP20-201ENST00000588011 210 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 TTN-AS1-228ENST00000589234 751 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AL161729.3-201ENST00000603533 673 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AC012640.3-201ENST00000607847 430 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AC015922.4-201ENST00000612568 690 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 MED24-234ENST00000614384 454 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AC106875.2-201ENST00000617634 596 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 CU638689.4-205ENST00000623313 596 ntTSL 4 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 RASSF3-206ENST00000637125 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 MITF-214ENST00000472437 1995 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 SMAD5-AS1-201ENST00000297163 1816 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 INPP5B-205ENST00000373027 3905 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AC245177.1-201ENST00000375625 2369 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AC239585.1-201ENST00000375644 2369 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 AL390726.6-201ENST00000637760 1654 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 LDB2-203ENST00000502640 2626 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 SORBS1-203ENST00000354106 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 EEF1A1P11-201ENST00000415278 1389 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 ZMIZ1-AS1-201ENST00000428862 2851 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TIMMDC1Q9NPL8 BBX-207ENST00000416476 2178 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 151 ms