Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 AC008695.1-201ENST00000514667 6393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
BEST4Q8NFU0 LINC02382-201ENST00000515840 614 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
BEST4Q8NFU0 AP003467.1-201ENST00000517397 301 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
BEST4Q8NFU0 AC078899.1-201ENST00000521432 1185 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
BEST4Q8NFU0 C11orf1-203ENST00000529270 1437 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
BEST4Q8NFU0 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
BEST4Q8NFU0 MTND2P17-201ENST00000550281 688 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
BEST4Q8NFU0 AC124312.1-201ENST00000551312 1325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
BEST4Q8NFU0 AC089984.3-201ENST00000552838 363 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
BEST4Q8NFU0 AL356017.1-201ENST00000556796 594 ntTSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
BEST4Q8NFU0 WDR61-205ENST00000558459 884 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
BEST4Q8NFU0 AC025040.1-201ENST00000560375 1284 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
BEST4Q8NFU0 AC004023.1-201ENST00000561473 1744 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
BEST4Q8NFU0 AC009117.3-202ENST00000563825 557 ntTSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
BEST4Q8NFU0 AC106729.1-201ENST00000567777 466 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
BEST4Q8NFU0 AC009019.1-203ENST00000568603 515 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
BEST4Q8NFU0 AC090826.1-203ENST00000569235 490 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
BEST4Q8NFU0 AL031429.2-201ENST00000602605 649 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
BEST4Q8NFU0 AC008555.7-201ENST00000605008 583 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
BEST4Q8NFU0 AL591167.1-201ENST00000607321 456 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
BEST4Q8NFU0 SNORA35B-201ENST00000607417 129 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
BEST4Q8NFU0 AC004921.1-201ENST00000608884 733 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
BEST4Q8NFU0 LINC01396-201ENST00000609099 527 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
BEST4Q8NFU0 MIR4435-2HG-220ENST00000609902 603 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
BEST4Q8NFU0 PROX1-AS1-219ENST00000610094 791 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
BEST4Q8NFU0 MIR6726-201ENST00000613751 61 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
BEST4Q8NFU0 AC020658.4-201ENST00000613987 684 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
BEST4Q8NFU0 AC015712.7-201ENST00000615211 635 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
BEST4Q8NFU0 GTF2IRD2P1-202ENST00000618962 3055 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
BEST4Q8NFU0 LINC01748-203ENST00000634836 3229 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
BEST4Q8NFU0 OR10R2-202ENST00000641067 1132 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
BEST4Q8NFU0 OR10R2-203ENST00000641400 975 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
BEST4Q8NFU0 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
BEST4Q8NFU0 AK9-204ENST00000424296 6326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
BEST4Q8NFU0 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
BEST4Q8NFU0 FAM114A2-201ENST00000351797 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
BEST4Q8NFU0 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
BEST4Q8NFU0 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
BEST4Q8NFU0 MTHFD2L-201ENST00000325278 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
BEST4Q8NFU0 ZFP14-201ENST00000270001 7489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
BEST4Q8NFU0 DOCK10-202ENST00000409592 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
BEST4Q8NFU0 GABRA2-205ENST00000507069 1562 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
BEST4Q8NFU0 AL132656.3-201ENST00000606384 1595 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
BEST4Q8NFU0 AC120036.2-201ENST00000509729 1474 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
BEST4Q8NFU0 RBMS2-202ENST00000542360 1484 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
BEST4Q8NFU0 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
BEST4Q8NFU0 OFD1P15Y-201ENST00000411536 1392 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
BEST4Q8NFU0 TAF9-205ENST00000506736 1331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
BEST4Q8NFU0 RUNX1T1-234ENST00000521553 1346 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
BEST4Q8NFU0 RN7SKP145-201ENST00000363291 303 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
BEST4Q8NFU0 NPL-202ENST00000367552 745 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
BEST4Q8NFU0 MYL6P5-201ENST00000412707 459 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
BEST4Q8NFU0 RPL21P50-201ENST00000417698 477 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
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BEST4Q8NFU0 PPP2R2DP1-201ENST00000420526 637 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
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BEST4Q8NFU0 TSSK4-203ENST00000428351 576 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
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BEST4Q8NFU0 AC108866.1-203ENST00000504106 529 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
BEST4Q8NFU0 GLUD1P3-202ENST00000508551 200 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
BEST4Q8NFU0 AC147055.1-201ENST00000509261 750 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
BEST4Q8NFU0 OR4D12P-201ENST00000509361 911 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
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BEST4Q8NFU0 LINC02503-201ENST00000510505 812 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
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BEST4Q8NFU0 KHDC1P1-201ENST00000511053 508 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
BEST4Q8NFU0 NPM1P21-201ENST00000513394 762 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
BEST4Q8NFU0 MINOS1P4-201ENST00000515470 318 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
BEST4Q8NFU0 C8orf44-205ENST00000521889 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
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BEST4Q8NFU0 OR4C49P-201ENST00000563891 900 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
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BEST4Q8NFU0 Metazoa_SRP.38-201ENST00000615981 254 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
BEST4Q8NFU0 AC107905.1-201ENST00000616204 426 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
BEST4Q8NFU0 AL391597.1-201ENST00000618707 694 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
BEST4Q8NFU0 AC241377.1-201ENST00000619797 406 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
BEST4Q8NFU0 AC117503.3-201ENST00000623811 601 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
BEST4Q8NFU0 AJ009632.2-203ENST00000634708 1205 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
BEST4Q8NFU0 LARP7-210ENST00000509061 2332 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
BEST4Q8NFU0 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
BEST4Q8NFU0 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
BEST4Q8NFU0 CACNB4-221ENST00000636130 7748 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
BEST4Q8NFU0 RAPGEF4-213ENST00000535187 3707 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.6
BEST4Q8NFU0 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
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