Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

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Length 404 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 AC017074.2-201ENST00000439382 607 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 MIR4435-2HG-209ENST00000441075 704 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 SDCBP-205ENST00000447267 772 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 377 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 CFHR2-203ENST00000476712 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 AC006296.2-201ENST00000507932 764 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 DUTP7-201ENST00000507982 486 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 AC074087.1-201ENST00000512059 724 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 AC112206.4-201ENST00000515142 405 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 AC109830.1-202ENST00000515491 860 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 SNORA70.20-201ENST00000516848 126 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 OR56A7P-201ENST00000524865 941 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 KCTD9P4-201ENST00000526766 1166 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 AC092821.2-201ENST00000545710 2042 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 AC025031.1-201ENST00000552634 562 ntTSL 4 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 AL132657.2-201ENST00000564417 358 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 AC009019.1-203ENST00000568603 515 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 AC099850.2-201ENST00000577660 557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 MIR4505-201ENST00000582238 73 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 AL049840.6-201ENST00000604583 345 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 AC253576.2-201ENST00000618815 580 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 TADA2A-212ENST00000620367 1043 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 ST6GALNAC3-203ENST00000621530 617 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 AL691477.1-201ENST00000624398 162 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 AC092375.1-202ENST00000639452 404 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 CNTRL-207ENST00000373855 7660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 GRIA2-204ENST00000393815 5260 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 CLEC12B-202ENST00000396502 3029 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 HTR4-206ENST00000520086 2272 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 PARN-201ENST00000341484 2100 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 SPIRE1-206ENST00000453447 2107 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 TRRAP-201ENST00000355540 12590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 ROR1-AS1-202ENST00000424995 2189 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 OSBPL9-206ENST00000453295 2842 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 POT1-202ENST00000393329 3950 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 ZSCAN26-201ENST00000316606 2362 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 AL359091.1-201ENST00000449048 1734 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 UNC80-201ENST00000272845 13440 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 FCGR1B-209ENST00000616817 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 KNL1-201ENST00000346991 9573 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 PRSS37-201ENST00000350549 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 WFDC8-202ENST00000357199 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 RNU6-167P-201ENST00000384292 106 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 HMGB1P20-201ENST00000402555 677 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 AL353626.3-201ENST00000413399 657 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 LINC00446-201ENST00000414743 459 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 LINC02518-201ENST00000421737 524 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
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SYNE4Q8N205 LINC01760-201ENST00000423410 382 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
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SYNE4Q8N205 NIPA2P1-201ENST00000426223 976 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 AC126120.1-201ENST00000431082 470 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 RPS7P3-201ENST00000443360 580 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
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SYNE4Q8N205 LINC01809-201ENST00000448431 303 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 LINC01473-203ENST00000456653 1079 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
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SYNE4Q8N205 APOPT1-204ENST00000473127 739 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 C21orf62-202ENST00000479548 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
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SYNE4Q8N205 AC118658.2-201ENST00000618697 459 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 AC130448.2-201ENST00000624082 374 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 ATM-229ENST00000639953 587 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 OR11H2-202ENST00000641517 1085 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
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SYNE4Q8N205 DCP1A-206ENST00000610213 5994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 BRD7P6-201ENST00000431406 1860 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 MEIS1-209ENST00000488550 5111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 ADGB-205ENST00000397944 5325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 AC104066.2-201ENST00000564513 1741 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 DNM1L-203ENST00000381000 4397 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 CLEC4E-201ENST00000299663 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 SGK3-201ENST00000345714 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 DLC1-202ENST00000316609 1837 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
SYNE4Q8N205 AC012618.3-201ENST00000415793 2042 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 AC004852.2-201ENST00000614289 2218 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 MYRFL-201ENST00000299350 820 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 CAV1-204ENST00000393470 598 ntTSL 4 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 LSM5-203ENST00000409782 649 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 PTCD2P2-201ENST00000415579 1095 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 RPL36P18-201ENST00000419316 318 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 GNRH1-202ENST00000421054 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 MTCYBP32-201ENST00000427945 1084 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 MTATP6P17-201ENST00000431030 672 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 HSFY7P-201ENST00000432672 318 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 AC010723.1-201ENST00000435111 540 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 HSFY8P-201ENST00000437934 318 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 AC073909.1-201ENST00000447112 999 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 SDC4P-201ENST00000453285 601 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 HSFY5P-201ENST00000453726 309 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 HAUS1P1-201ENST00000505275 832 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 AC024451.1-201ENST00000508013 779 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SYNE4Q8N205 AC106894.1-201ENST00000511735 451 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
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