Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4

BBS9, Protein PTHB1, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS9Q3SYG4 AL049869.4-201ENST00000555669 178 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 TRIM69-204ENST00000558329 1211 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 AC090888.1-201ENST00000561335 1141 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 LINC02170-201ENST00000561519 555 ntTSL 4 BASIC7.04□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 AC092376.1-201ENST00000569677 335 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 MIR5705-201ENST00000579870 89 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 AC138207.8-206ENST00000580053 637 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 AC016382.1-201ENST00000583580 387 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 AC015878.1-201ENST00000584611 679 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 AC105227.1-201ENST00000586227 438 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 AC073862.4-201ENST00000622982 854 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 AL513321.2-202ENST00000634479 921 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 CTBS-202ENST00000370630 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 CA10-204ENST00000570565 2276 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 ZC3H11A-201ENST00000332127 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 OR51E1-201ENST00000396952 3612 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 AC025263.3-201ENST00000622965 1396 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 NALCN-201ENST00000251127 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 AC093278.2-201ENST00000564956 2485 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 CDC7-203ENST00000428239 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 Z93929.1-201ENST00000418200 1475 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 AKAP5-202ENST00000394718 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 AC007406.5-201ENST00000570140 3170 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 SLC26A7-202ENST00000309536 2656 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 CASP10-205ENST00000360132 5814 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 SELP-203ENST00000367788 2427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 IL20-202ENST00000367098 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 GPR1-203ENST00000437420 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 DDX6-208ENST00000620157 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 DOCK11-201ENST00000276202 6625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 KLRC1-201ENST00000347831 1332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 SPAG9-209ENST00000510283 4949 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 PDE8B-208ENST00000505283 3474 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 SLC22A25-201ENST00000306494 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 CDKAL1-204ENST00000613575 1673 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 ZHX3-205ENST00000432768 3551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 CTNND1-212ENST00000525902 4984 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 CTNND1-214ENST00000526772 4966 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 TEAD1-201ENST00000334310 3075 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 TEAD1-205ENST00000527575 3063 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 MANSC1-204ENST00000545735 1501 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 C12orf50-203ENST00000550553 1525 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 MYCBP2-212ENST00000612956 1542 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 AADAC-201ENST00000232892 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 CDY19P-201ENST00000411668 1613 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 CDY18P-201ENST00000438294 1609 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 OR1N2-201ENST00000373688 1103 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 AL049697.3-201ENST00000406493 982 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 MIR1231-201ENST00000408101 92 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 RN7SKP39-201ENST00000410773 322 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 RAP1BP1-201ENST00000412709 553 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 AL356968.2-201ENST00000412769 1257 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 RPSAP60-201ENST00000415403 880 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 AL356320.2-201ENST00000417263 507 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 PTP4A1P5-201ENST00000420305 455 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 EIF4A1P2-201ENST00000422633 1220 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 TTC3-AS1-201ENST00000424733 1097 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 HIGD1AP12-201ENST00000427832 281 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 OR6R1P-201ENST00000431838 940 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 AC105052.2-201ENST00000434317 794 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 ST13P2-201ENST00000438916 1109 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 SEPT14P24-201ENST00000447236 180 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 RNF148-202ENST00000447240 839 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 MRPL35P2-201ENST00000448009 511 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 AL138737.1-201ENST00000456896 1252 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 RPL7P32-201ENST00000457119 744 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 C1orf105-204ENST00000460397 462 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 RN7SL647P-201ENST00000485429 300 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 AC023050.1-201ENST00000498198 304 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 LINC02173-201ENST00000504132 521 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 LINC02147-201ENST00000509367 807 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 AC022639.1-204ENST00000520365 569 ntTSL 4 BASIC7.03□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 NECAB1-205ENST00000522820 811 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 OR5M4P-201ENST00000529436 925 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 AP006587.5-201ENST00000532033 739 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 CLEC2B-202ENST00000538152 745 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 INO80-AS1-202ENST00000560178 444 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 AL031846.1-201ENST00000560933 314 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
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BBS9Q3SYG4 MIR4258-201ENST00000580920 91 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 AC011824.1-201ENST00000584863 561 ntTSL 4 BASIC7.03□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 AC008752.2-201ENST00000591174 750 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 AC006116.6-201ENST00000593258 1103 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 CYCSP1-201ENST00000604815 315 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 AC105129.3-201ENST00000605455 485 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 AC245297.2-201ENST00000610119 565 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 AC015574.1-202ENST00000616588 456 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 AC120057.5-201ENST00000623840 154 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 AC005154.1-203ENST00000626245 451 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 SATB1-AS1-259ENST00000629477 853 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 AC017000.1-201ENST00000639380 578 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 AL354702.2-202ENST00000641481 890 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 TRPM7-201ENST00000313478 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 PLCB4-202ENST00000378473 5619 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 COMMD8-201ENST00000381571 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 GRPR-201ENST00000380289 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 ST7-203ENST00000393443 2360 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 HEMK1-203ENST00000434410 17064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
BBS9Q3SYG4 GFPT1-202ENST00000361060 8632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
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