Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 PDCD10-216ENST00000492396 814 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 RPL37AP8-201ENST00000494116 276 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 RBBP4P1-201ENST00000502424 1276 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 AC108866.1-204ENST00000508362 558 ntTSL 4 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 AC022441.2-201ENST00000514113 382 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 CR383658.1-201ENST00000514609 734 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 RNA5SP434-201ENST00000516647 121 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 AC090150.1-201ENST00000521408 585 ntTSL 4 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 MED21-206ENST00000546323 575 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 ANKRD20A5P-203ENST00000580200 566 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 AC005726.4-201ENST00000582858 458 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 ODF4-202ENST00000584943 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 AC006116.5-201ENST00000591936 559 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 LINC01198-204ENST00000594153 552 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 BNIP3P27-201ENST00000599991 412 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 AP001823.1-201ENST00000604056 1003 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 AC027449.1-201ENST00000608890 407 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 AL161457.2-204ENST00000609241 869 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 AL365181.4-201ENST00000609800 547 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 AL121904.1-201ENST00000611894 948 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 RDM1-219ENST00000615378 542 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 AC003001.2-201ENST00000616294 831 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 AC005261.2-201ENST00000593427 4258 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 AC105105.2-201ENST00000590797 4521 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 ZNF813-201ENST00000396403 6151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 AC093225.1-201ENST00000506867 1408 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 PGM3-215ENST00000616566 5905 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 FAM205BP-203ENST00000455647 3752 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 IL23R-201ENST00000347310 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 ERMARD-202ENST00000366772 2003 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 PDE1A-204ENST00000410103 2000 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 AC124017.1-201ENST00000508112 1594 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 CADM2-202ENST00000405615 1314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 IL21-AS1-201ENST00000417927 3748 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 RORB-201ENST00000376896 9551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 ZMYM2-210ENST00000610343 10200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 AC022325.1-201ENST00000502748 2199 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 LINC02183-201ENST00000637822 1732 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 COX6B1P3-201ENST00000312310 260 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
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CCDC142Q17RM4 S100A5-201ENST00000368717 506 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
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CCDC142Q17RM4 LINC00310-202ENST00000419881 910 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
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CCDC142Q17RM4 TWF1-207ENST00000548315 1170 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
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CCDC142Q17RM4 RPL36A-209ENST00000553110 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
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CCDC142Q17RM4 AL391834.2-201ENST00000609982 546 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 AC092266.1-201ENST00000610958 165 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 MIR6778-201ENST00000617912 73 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 AC021766.1-201ENST00000624404 741 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 KCNA2-209ENST00000639048 10836 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 TMED3-202ENST00000424155 16555 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 RAD54B-201ENST00000297592 1879 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 CERS3-203ENST00000538112 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 HYAL4-202ENST00000476325 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 TEX9-203ENST00000558083 4440 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 SNX18P3-202ENST00000565670 1750 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 RBM22-202ENST00000447771 1386 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 PSG7-206ENST00000623675 1392 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 UNC5C-205ENST00000610318 9403 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 IBTK-210ENST00000610980 5195 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 PTPRB-210ENST00000551525 5291 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 SLC39A12-201ENST00000377369 2808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 SETD2-202ENST00000409792 8142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 ZNF254-208ENST00000616028 3886 ntTSL 4 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CCDC142Q17RM4 FSCB-201ENST00000340446 2938 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
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