Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 SV2B-202ENST00000394232 11279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
IRF4Q15306 GRIK1-201ENST00000327783 3179 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
IRF4Q15306 PTPN3-202ENST00000374541 6703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
IRF4Q15306 RASSF8-201ENST00000282884 1994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
IRF4Q15306 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
IRF4Q15306 AFP-202ENST00000395792 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
IRF4Q15306 PSG4-201ENST00000244295 1629 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
IRF4Q15306 ODF2-205ENST00000393527 3653 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
IRF4Q15306 HHLA1-201ENST00000414222 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
IRF4Q15306 Z95114.1-201ENST00000624264 14574 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
IRF4Q15306 CCR6-201ENST00000341935 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
IRF4Q15306 PRSS37-201ENST00000350549 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
IRF4Q15306 CLEC4A-203ENST00000352620 615 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
IRF4Q15306 CLEC4A-204ENST00000360500 597 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
IRF4Q15306 RN7SKP128-201ENST00000364270 303 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
IRF4Q15306 AC092642.1-201ENST00000392417 425 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
IRF4Q15306 AC245060.4-201ENST00000413293 1121 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
IRF4Q15306 LINC00383-201ENST00000433664 817 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
IRF4Q15306 AL445928.1-201ENST00000435545 222 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
IRF4Q15306 AL139161.2-201ENST00000438371 740 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
IRF4Q15306 AC019117.1-202ENST00000439046 589 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
IRF4Q15306 AL512637.1-201ENST00000439523 1231 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
IRF4Q15306 AL137186.1-201ENST00000440436 480 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
IRF4Q15306 AC022387.1-201ENST00000444770 794 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
IRF4Q15306 LINC01809-201ENST00000448431 303 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
IRF4Q15306 LINC00483-204ENST00000502517 940 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
IRF4Q15306 GYPB-213ENST00000513128 360 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
IRF4Q15306 LINC01033-204ENST00000523194 715 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
IRF4Q15306 LINC02411-203ENST00000546180 959 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
IRF4Q15306 AC006530.1-201ENST00000555980 571 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
IRF4Q15306 AL356801.1-201ENST00000559320 294 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
IRF4Q15306 AC009121.2-202ENST00000572706 505 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
IRF4Q15306 AL139220.2-221ENST00000628123 395 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
IRF4Q15306 AC245187.2-201ENST00000631520 475 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
IRF4Q15306 AC103703.1-201ENST00000634783 663 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
IRF4Q15306 UOX-205ENST00000640983 544 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
IRF4Q15306 MARCH7-201ENST00000259050 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
IRF4Q15306 AC123769.1-201ENST00000530992 3192 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
IRF4Q15306 AC006511.3-201ENST00000624929 1783 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
IRF4Q15306 CYLD-201ENST00000311559 5371 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
IRF4Q15306 BICD1-204ENST00000548411 8811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
IRF4Q15306 MFSD8-201ENST00000296468 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
IRF4Q15306 CHRDL1-202ENST00000372045 3860 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
IRF4Q15306 NEPNP-201ENST00000404786 1371 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
IRF4Q15306 MAPKAPK5P1-201ENST00000431810 1376 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
IRF4Q15306 FRK-201ENST00000606080 13230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
IRF4Q15306 AC083837.1-201ENST00000565297 2994 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
IRF4Q15306 IFI16-204ENST00000368131 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
IRF4Q15306 DAB2-209ENST00000509337 2740 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
IRF4Q15306 CACNB4-234ENST00000636785 3787 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
IRF4Q15306 EIF5AL1-201ENST00000520547 3840 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
IRF4Q15306 ANKRD46-204ENST00000519597 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
IRF4Q15306 ZEB2-244ENST00000638007 9140 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
IRF4Q15306 LINC01152-201ENST00000472655 3578 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
IRF4Q15306 AP002478.1-201ENST00000577848 1455 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
IRF4Q15306 LINC02119-201ENST00000508853 2573 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
IRF4Q15306 SGIP1-201ENST00000237247 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
IRF4Q15306 RAB30-214ENST00000534141 3746 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
IRF4Q15306 CCR2-201ENST00000292301 2671 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
IRF4Q15306 LYPD6B-201ENST00000280115 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
IRF4Q15306 RNA5SP500-201ENST00000364486 119 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
IRF4Q15306 AC016739.1-201ENST00000405359 345 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
IRF4Q15306 RN7SKP151-201ENST00000410230 316 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
IRF4Q15306 RN7SKP166-201ENST00000410812 305 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
IRF4Q15306 AC116036.1-201ENST00000412199 367 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
IRF4Q15306 AL606534.1-201ENST00000439562 694 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
IRF4Q15306 RPL31P15-201ENST00000449770 338 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
IRF4Q15306 RPL7L1P3-201ENST00000455249 689 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
IRF4Q15306 SETP4-201ENST00000455717 868 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
IRF4Q15306 AC124945.1-201ENST00000485133 188 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
IRF4Q15306 RN7SL57P-201ENST00000493687 290 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
IRF4Q15306 AC124893.1-201ENST00000496247 545 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
IRF4Q15306 CCDC11P1-201ENST00000503137 1162 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
IRF4Q15306 AC109361.2-202ENST00000512514 483 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
IRF4Q15306 MTATP6P1-201ENST00000514057 681 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
IRF4Q15306 AC010230.1-201ENST00000514115 443 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
IRF4Q15306 PDE4D-225ENST00000515835 590 ntTSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
IRF4Q15306 AP000648.1-201ENST00000529682 397 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
IRF4Q15306 MITF-217ENST00000531774 1074 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
IRF4Q15306 LINC01234-204ENST00000550905 589 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
IRF4Q15306 AC027808.1-201ENST00000560873 683 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
IRF4Q15306 AC100821.2-201ENST00000565668 440 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
IRF4Q15306 SSX4B-201ENST00000595235 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
IRF4Q15306 SSX4-201ENST00000595689 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
IRF4Q15306 RPL12P48-201ENST00000605620 304 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
IRF4Q15306 AL031601.1-201ENST00000605702 394 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
IRF4Q15306 AC021422.1-201ENST00000621212 473 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
IRF4Q15306 OR8G3P-202ENST00000641572 1255 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
IRF4Q15306 SOS1-201ENST00000395038 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
IRF4Q15306 PIGN-247ENST00000640540 4720 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
IRF4Q15306 RAD54B-201ENST00000297592 1879 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
IRF4Q15306 RBMY1F-201ENST00000303766 1887 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
IRF4Q15306 RALGAPA2-201ENST00000202677 6152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
IRF4Q15306 CLIP4-202ENST00000401605 2322 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
IRF4Q15306 LUZP2-201ENST00000336930 3553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
IRF4Q15306 FLJ12825-201ENST00000515617 3942 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
IRF4Q15306 NOVA1-206ENST00000539517 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
IRF4Q15306 NEGR1-202ENST00000357731 12811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
IRF4Q15306 PARP4P2-201ENST00000446672 3326 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
IRF4Q15306 PGM3-215ENST00000616566 5905 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
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