Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 AC093325.1-201ENST00000508378 326 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 B3GNTL1P1-201ENST00000509174 289 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 AC139491.5-201ENST00000510029 920 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 PDE4D-225ENST00000515835 590 ntTSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 C8orf22-203ENST00000517663 788 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 AC130366.1-201ENST00000526505 1192 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 ACER3-213ENST00000533873 929 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 AC140063.1-201ENST00000541343 259 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 IFNG-AS1-203ENST00000541715 902 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 AL162511.1-201ENST00000556542 879 ntTSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 LINC00640-204ENST00000557295 708 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 LINC01917-201ENST00000565170 1037 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 CCDC58P1-201ENST00000578567 430 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 MIR3189-201ENST00000578735 73 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 AC135178.4-201ENST00000585275 548 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 ZNF675-208ENST00000601010 669 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 AC027334.1-201ENST00000603257 310 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 AC034236.3-201ENST00000605999 461 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 SLC1A3-215ENST00000612708 3832 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 AP000720.1-201ENST00000625091 483 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 AC010401.2-201ENST00000575137 4934 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 AC026523.2-201ENST00000625039 7739 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 MAPK10-341ENST00000641657 3860 ntAPPRIS P2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 FILIP1L-202ENST00000354552 3970 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 AC243772.3-201ENST00000617878 1537 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 AC007342.5-201ENST00000571340 2142 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 AC093671.1-201ENST00000624981 2929 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 LINC01470-202ENST00000506723 2193 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 ORC4-214ENST00000535373 6710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 EXOC1-201ENST00000346134 3357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 RUBCNL-205ENST00000389908 3956 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 ZNF418-212ENST00000616958 2212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 AC011912.1-201ENST00000623483 5819 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 LINC00326-202ENST00000457339 2515 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 HACD3-211ENST00000569894 1471 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 ADAMDEC1-201ENST00000256412 2348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 RNA5SP152-201ENST00000365184 110 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 ARV1-202ENST00000366658 1170 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 RNA5SP474-201ENST00000391234 90 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 HMGB3P7-201ENST00000400214 611 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 RAD23B-202ENST00000416373 3835 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 AC105275.1-201ENST00000417794 491 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 C7orf69-201ENST00000418326 675 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 AC000089.1-201ENST00000424559 801 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 NDUFA5P10-201ENST00000432147 357 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 KRT8P51-201ENST00000438938 274 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 AL513321.1-201ENST00000441175 761 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 LRRC28-203ENST00000447360 1235 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 RPL7AP71-201ENST00000451120 739 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 AL450344.2-201ENST00000455229 614 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 OSTCP1-201ENST00000455507 450 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 CYCSP53-201ENST00000455540 265 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 AC073636.1-202ENST00000457756 558 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 CFHR2-203ENST00000476712 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 AC122714.1-201ENST00000502510 459 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 AC093895.1-201ENST00000506480 821 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 AC008628.1-201ENST00000508663 265 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 AC124854.1-201ENST00000512210 511 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 LINC02358-201ENST00000514413 465 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 CYP4F27P-201ENST00000514557 494 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 AC010442.1-201ENST00000515583 816 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 AC008691.1-202ENST00000521472 811 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 AP002004.1-206ENST00000532441 876 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 CTNNA3-205ENST00000545309 555 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 PPIAL4C-201ENST00000585245 600 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 AC023421.2-202ENST00000586213 547 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 LINC02028-206ENST00000593326 810 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 LINC01198-204ENST00000594153 552 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 ZRANB2-AS2-215ENST00000596952 624 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 AL590032.1-201ENST00000604920 252 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 DARS-AS1-221ENST00000608471 532 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 AL512506.1-201ENST00000613918 449 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 GXYLT1P5-202ENST00000618830 589 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 AC027559.1-201ENST00000636288 271 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 ECHDC1-222ENST00000531967 2585 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 RABL3-201ENST00000273375 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 DGKB-203ENST00000403951 6917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 PSMC6-201ENST00000445930 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 AP001002.1-201ENST00000625148 1513 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 SCAPER-207ENST00000563290 5028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 IFIT2-203ENST00000638108 3703 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 FCHSD2-208ENST00000458644 2215 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 RNF145-201ENST00000274542 3364 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 PKIA-AS1-202ENST00000522302 2011 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 FCGR1B-209ENST00000616817 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 GABRA1-215ENST00000636573 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 MARCH7-201ENST00000259050 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 AC239809.3-214ENST00000496508 2513 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 MBNL2-203ENST00000376673 4632 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 SPAM1-203ENST00000402183 1860 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 BBIP1-207ENST00000448814 2119 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 SAMD13-201ENST00000370668 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 ZCCHC8-201ENST00000536306 2904 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 RASSF8-213ENST00000542865 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 AL359955.1-201ENST00000455242 3275 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 AC091045.1-201ENST00000561460 2277 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 ZNF806-201ENST00000438300 1774 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 OR4D11-201ENST00000313253 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
BRD3Q15059 OR4K13-201ENST00000315693 915 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.5 ms