Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 HAVCR1-204ENST00000522693 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 ROR1-204ENST00000545203 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 UGT2B11-201ENST00000446444 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 LEPR-205ENST00000371060 5135 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 CASC19-238ENST00000641523 1558 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 AP002004.1-201ENST00000532510 3530 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 MEIOB-205ENST00000470044 1857 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 AC092724.1-201ENST00000624623 3397 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 GBP1-201ENST00000370473 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 TMEM133-201ENST00000303130 1953 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 OR11H1-201ENST00000252835 982 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 TMSB4XP2-201ENST00000335179 210 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 RNA5SP477-201ENST00000362639 119 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 AL445238.1-204ENST00000400311 463 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 CCL20-202ENST00000409189 839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 CDY8P-201ENST00000428380 1279 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 AL035701.1-202ENST00000437249 371 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 LINC02096-201ENST00000445035 953 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 AC073109.1-201ENST00000445066 978 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 CDY20P-201ENST00000447528 1279 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 OR2AF1P-201ENST00000454899 889 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 AC007386.1-201ENST00000455212 582 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 SETP20-201ENST00000457046 852 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 AC090958.1-201ENST00000511122 351 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 AC114781.3-201ENST00000512083 142 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 LINC02196-201ENST00000512838 568 ntTSL 4 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 RNA5SP434-201ENST00000516647 121 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 AC060775.1-201ENST00000518241 520 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 IGKV3D-34-201ENST00000522638 302 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 RNASE11-208ENST00000555841 886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 OR11H2-201ENST00000556246 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 AL157938.2-202ENST00000588378 875 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 AC020909.2-201ENST00000595005 626 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 AC024255.1-201ENST00000614376 102 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 TCL6_3.1-201ENST00000619064 137 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 RSU1P2-204ENST00000619977 1240 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 AC129915.3-201ENST00000634128 948 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 OR8G5-202ENST00000641707 1156 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 MCMDC2-204ENST00000422365 5096 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 PSG7-206ENST00000623675 1392 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 C12orf4-209ENST00000545746 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 MSL2-202ENST00000434835 2272 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 SEPT7-203ENST00000399035 4066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 AL050403.1-201ENST00000448859 2006 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 AC124017.1-201ENST00000508112 1594 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 ZNF233-205ENST00000592581 2938 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 PRKDC-202ENST00000338368 12784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 FBXO3-208ENST00000530401 7410 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 TRAPPC3L-201ENST00000356128 2421 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 TTN-AS1-203ENST00000419746 4592 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 ADGRE1-202ENST00000312053 3128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 AC105235.1-201ENST00000623208 1816 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 THAP6-201ENST00000311638 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 MPDZ-208ENST00000447879 6262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 FAM162A-201ENST00000232125 801 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 RNA5SP273-201ENST00000362484 113 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 SLC20A1P1-201ENST00000413906 956 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 MTND4LP21-201ENST00000415303 295 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 HTR5BP-202ENST00000434708 1193 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 LDHAP2-201ENST00000437325 985 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 THAP12P8-201ENST00000447914 2115 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 MGAT2P1-201ENST00000449718 797 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 PPIAP20-201ENST00000449839 135 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 LINC02278-201ENST00000512170 500 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 RNU6-943P-201ENST00000516960 98 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 AC013644.1-201ENST00000523724 555 ntTSL 4 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 AP003306.1-201ENST00000529875 353 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 OLR1-210ENST00000544577 924 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 AC007956.1-201ENST00000555623 542 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 AC106037.2-201ENST00000578583 447 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 RN7SL753P-201ENST00000581238 290 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 MIR3614-201ENST00000581261 86 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 AC243967.1-201ENST00000598976 578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 AC100767.2-201ENST00000604840 693 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 AC092944.2-201ENST00000605443 889 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 PCBP1-AS1-286ENST00000625888 765 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 AC073488.3-201ENST00000631611 778 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 LINC02141-201ENST00000568279 6586 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 MDM2-201ENST00000258148 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 OR5T1-202ENST00000641665 1471 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 MAPK9-213ENST00000539014 1668 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 FSCB-201ENST00000340446 2938 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 ZEB2-241ENST00000637304 9158 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 ARHGAP29-201ENST00000260526 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 RIMS2-209ENST00000507740 8002 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 KSR2-201ENST00000339824 17726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 CABS1-201ENST00000273936 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 ZNF192P1-201ENST00000440790 1628 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 AC068775.1-202ENST00000538173 1602 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.2
CHAF1AQ13111 CUL1-204ENST00000617797 2508 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 MOCS2-201ENST00000361377 3568 ntTSL 4 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 AC022325.1-201ENST00000502748 2199 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 LINC00700-201ENST00000413603 2097 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 CC2D2B-202ENST00000410012 1792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 CLEC6A-201ENST00000382073 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 LNX2-201ENST00000316334 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 C3orf35-203ENST00000425564 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
CHAF1AQ13111 FOXP2-217ENST00000462331 1388 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
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