Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 AC090510.2-201ENST00000617465 629 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 CLEC6A-201ENST00000382073 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 OR9G1-202ENST00000642097 3611 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 NANOG-201ENST00000229307 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 NUMB-223ENST00000556772 5172 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 AC079777.1-201ENST00000623836 1953 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 TTC39C-201ENST00000304621 2304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 SLC26A5-205ENST00000393723 2174 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 KCNN3-201ENST00000271915 13033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 PIGN-239ENST00000639902 4439 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 PUM1-205ENST00000424085 4631 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 DEFB118-201ENST00000253381 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
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BPTFQ12830 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 AL713851.2-201ENST00000431209 332 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 AC079922.1-201ENST00000443291 359 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 AC022387.1-201ENST00000444770 794 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 STRADBP1-201ENST00000478954 1281 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 BACH1-IT1-201ENST00000504298 821 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 WDYHV1-203ENST00000518125 880 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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BPTFQ12830 AL133240.1-201ENST00000553537 580 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 AC008109.1-201ENST00000583163 826 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 GMFG-212ENST00000602185 423 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 AL591926.2-202ENST00000615199 719 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 KDM4C-214ENST00000536108 3406 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 AQP9-201ENST00000219919 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 MARK2P4-201ENST00000503381 2380 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 ZNF19-206ENST00000565100 2087 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 KRT222-202ENST00000394052 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 AFF2-203ENST00000370457 3952 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 TRPC5OS-201ENST00000371970 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 LINC02261-201ENST00000512873 2802 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 CEP152-202ENST00000380950 5635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 HTT-201ENST00000355072 13474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
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BPTFQ12830 STARD4-AS1-201ENST00000500779 5525 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
BPTFQ12830 ZNF630-202ENST00000409324 2455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
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BPTFQ12830 LINC01203-201ENST00000419566 580 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
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BPTFQ12830 YIPF4-201ENST00000238831 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
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BPTFQ12830 CCL4-202ENST00000615863 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
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BPTFQ12830 FRG2FP-204ENST00000453982 852 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
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BPTFQ12830 AC116424.1-203ENST00000513940 671 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 SETP21-201ENST00000514799 892 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 MIR4330-201ENST00000579077 105 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 SDAD1-203ENST00000395711 2513 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 ARL17A-202ENST00000336125 3945 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 AL356317.1-201ENST00000396110 1436 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 ABCA9-202ENST00000453985 6116 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 OR13C1P-202ENST00000641378 2919 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 OR7E122P-202ENST00000641144 6171 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 AC016745.2-201ENST00000608834 3443 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 KLF7-201ENST00000309446 8362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 TP53BP1-201ENST00000263801 6346 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 SPINK7-201ENST00000274565 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 OR2J1-201ENST00000377171 1273 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 AL162385.2-201ENST00000437864 285 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
BPTFQ12830 AL354793.1-201ENST00000446028 713 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
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