Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 AL359922.1-201ENST00000404796 935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 AL353692.2-201ENST00000407054 335 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 GSTM2-205ENST00000414179 982 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 AL359378.2-201ENST00000415575 746 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 AL929472.1-201ENST00000417484 429 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 AC011752.1-203ENST00000417609 582 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 AL359382.1-201ENST00000417838 426 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 ZNF736P7Y-201ENST00000425158 820 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 MORF4L1P7-201ENST00000426038 703 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 GACAT1-202ENST00000441383 540 ntTSL 4 BASIC7.19□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 Z83846.1-201ENST00000446798 265 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 LINC00704-203ENST00000449712 703 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 PPIAP27-201ENST00000453800 265 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 AL359265.3-201ENST00000456125 579 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 AL390783.1-203ENST00000457058 248 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 SULT1D1P-201ENST00000458020 882 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 AC007998.1-201ENST00000474156 672 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 RN7SL273P-201ENST00000481561 299 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 AC124945.1-201ENST00000485133 188 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 AC116634.1-201ENST00000506926 447 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 AC016642.1-202ENST00000509476 641 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 MTCO3P28-201ENST00000513351 515 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 AC060775.1-201ENST00000518241 520 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 OR7E13P-201ENST00000526052 910 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 DEFB134-202ENST00000526438 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 AC108471.2-203ENST00000532680 517 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 OR7A11P-201ENST00000597719 953 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 AC097467.3-216ENST00000599555 1293 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 AC133794.1-201ENST00000602731 914 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 AP001172.1-201ENST00000602921 581 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 AC013244.1-201ENST00000604279 193 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 CR589904.2-201ENST00000612533 440 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 MIR6811-201ENST00000620409 58 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 ZNF253-205ENST00000640599 1208 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 AC130360.2-201ENST00000533477 1556 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 N4BP2L1-209ENST00000530622 1897 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 GIGYF2-246ENST00000629305 7878 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 MTO1-202ENST00000370305 2174 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 LRRC37B-202ENST00000341671 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 POLR2B-202ENST00000381227 4108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 SMC1A-202ENST00000375340 9930 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 AXDND1-201ENST00000367618 3642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 NPHP3-AS1-202ENST00000504440 2507 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 ACPP-201ENST00000336375 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 CNTN1-204ENST00000547849 3125 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 AL022323.4-201ENST00000623980 13120 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 MDM4-216ENST00000616250 9597 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 AP002001.1-201ENST00000526101 1759 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 ABLIM1-207ENST00000392955 7408 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 LINC00907-201ENST00000585627 3324 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 RACGAP1-203ENST00000454520 3080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 C4orf26-201ENST00000311623 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 CDKL4-201ENST00000378803 1567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 RPL31P11-201ENST00000426558 1558 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 HMBOX1-206ENST00000519047 1551 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 ZC3H11A-204ENST00000367214 3451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 VTRNA3-1P-201ENST00000362552 102 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 AC115285.1-201ENST00000424879 736 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 AL669841.1-201ENST00000425723 558 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 AL590623.1-201ENST00000427864 105 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 AP000295.1-201ENST00000433395 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 AL049649.1-201ENST00000444792 1105 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 AC012355.1-201ENST00000450290 769 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 MIR4432HG-202ENST00000453476 703 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 SSBP1-205ENST00000465582 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 RPS26P39-201ENST00000469206 341 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 AC084211.1-201ENST00000473893 328 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 PRELID3BP5-201ENST00000508612 460 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 AC090572.3-201ENST00000519041 804 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 AZIN1-AS1-208ENST00000519257 619 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 AC079089.1-202ENST00000528800 1256 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 AL162632.2-201ENST00000553933 399 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 AC103740.1-202ENST00000558404 542 ntTSL 4 BASIC7.18□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 AC093510.2-201ENST00000562820 896 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 AC020978.2-201ENST00000563203 428 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 AC005776.1-201ENST00000603164 290 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 AC022387.2-201ENST00000604050 448 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 AC022467.1-201ENST00000614738 749 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 KLRC2-206ENST00000619500 883 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 AC127024.6-201ENST00000621598 424 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 AL161616.2-201ENST00000622001 565 ntTSL 4 BASIC7.18□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 AL137918.1-201ENST00000624542 1922 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 GCNT2-203ENST00000379597 4525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 TTC3-201ENST00000354749 9084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 TRMT10A-202ENST00000394876 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 AC073365.1-203ENST00000641055 1992 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 MAPK9-213ENST00000539014 1668 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 RBM22-202ENST00000447771 1386 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 DNAH17-201ENST00000389840 13723 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 ATAD1-202ENST00000328142 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 TMEM8B-202ENST00000377991 14112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 LINC01527-201ENST00000419578 1997 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 RIMKLB-207ENST00000538135 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 OR4F17-201ENST00000318050 1054 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 TMSB4XP4-201ENST00000323496 618 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 NOP10-201ENST00000328848 554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 PCYT1B-201ENST00000356768 1289 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 SNORA70H-201ENST00000383910 135 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 SNORA70J-201ENST00000384182 135 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
EPHB4P54760 RNY3P9-201ENST00000384727 106 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms