Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 RNASE9-205ENST00000553706 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 LINC01580-202ENST00000555364 661 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 AC078909.1-201ENST00000559509 464 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 MT1CP-201ENST00000567054 174 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 PWRN1-208ENST00000567647 561 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 AL078601.3-201ENST00000573303 535 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 AC127540.1-201ENST00000580311 689 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 AC091059.1-201ENST00000585190 215 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 AC012370.2-201ENST00000597541 1080 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 AC011468.3-201ENST00000597886 332 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 IGFL2-AS1-206ENST00000601263 446 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 AC010894.2-203ENST00000606406 499 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 AC005828.7-201ENST00000607331 556 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 PCA3_2.1-201ENST00000612507 409 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 AC104307.1-201ENST00000616142 196 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 SNX18P12-201ENST00000624821 759 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 MVP-219ENST00000629059 120 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 OR3A3-203ENST00000641141 3800 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 MAPK10-350ENST00000641777 965 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 IL23R-202ENST00000395227 1459 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 AC008163.1-201ENST00000636281 1455 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 ZNF644-204ENST00000370440 5702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 SLAMF6-202ENST00000368057 2712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 CLUL1-205ENST00000579494 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 SSXP3-201ENST00000442971 1300 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 SLC1A2-202ENST00000395750 11538 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 TEAD1-203ENST00000526600 8477 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 ROR1-AS1-202ENST00000424995 2189 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 AC005162.3-201ENST00000609389 3695 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 RBMY1HP-201ENST00000382759 1389 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 AL354854.1-201ENST00000455940 1363 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 TTN-AS1-203ENST00000419746 4592 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 SRGAP1-207ENST00000631006 8406 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 AC068389.1-202ENST00000526470 3564 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 DCTN5-201ENST00000300087 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 AC010401.2-201ENST00000575137 4934 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 ZNF615-213ENST00000602063 4094 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 RALGAPA1-202ENST00000382366 6328 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 SENP8-202ENST00000542035 1672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 MPP5-204ENST00000555925 5006 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 OR6C1-201ENST00000379668 1064 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 AL034417.1-201ENST00000399343 800 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 AL121977.1-201ENST00000401636 979 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 PPP1R7-203ENST00000401987 820 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 AL096711.1-201ENST00000404780 554 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 AL139805.1-201ENST00000407837 289 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 RPL23AP18-201ENST00000416139 468 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 LINC01752-201ENST00000417299 438 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 NMD3P2-201ENST00000421815 761 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 NLGN1-AS1-201ENST00000423873 815 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 AC018467.1-202ENST00000432612 533 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 AL353662.1-201ENST00000439099 327 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
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PGGT1BP53609 AC068491.1-201ENST00000449539 1241 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
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PGGT1BP53609 MTND6P32-201ENST00000457611 483 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
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PGGT1BP53609 AC098818.1-201ENST00000478593 252 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
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PGGT1BP53609 RN7SKP35-201ENST00000517210 151 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 AP000620.1-201ENST00000527147 504 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 RORA-AS2-202ENST00000561413 576 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 AL133297.1-201ENST00000568149 404 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
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PGGT1BP53609 AC021766.1-201ENST00000624404 741 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 NEMF-201ENST00000298310 6234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 DOCK9-208ENST00000448493 7887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 SMG1-201ENST00000330588 1588 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 CAPRIN2-203ENST00000417045 3535 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 BIRC3-207ENST00000615299 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 PBRM1-207ENST00000409767 4849 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 GPATCH2L-201ENST00000261530 14007 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 EPC2-201ENST00000258484 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 NOL4-202ENST00000535384 1853 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 AC021092.1-201ENST00000592946 3199 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 NPY5R-202ENST00000506953 1418 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 TTI1-203ENST00000449821 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 CWF19L2-201ENST00000282251 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 RASSF8-201ENST00000282884 1994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 PKN2-202ENST00000370513 2890 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 AC130304.1-201ENST00000622942 2385 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 BCL2A1-202ENST00000335661 809 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 XAGE5-201ENST00000351072 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 RNU4-23P-201ENST00000362839 140 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 APOOL-201ENST00000373173 1279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PGGT1BP53609 KLRC3-202ENST00000396439 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
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