Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

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Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 POM121L2-202ENST00000444565 3108 ntAPPRIS P2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CENPFP49454 NT5DC1-201ENST00000319550 6923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CENPFP49454 AC011369.2-201ENST00000624423 1567 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CENPFP49454 LINC01047-201ENST00000415193 778 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CENPFP49454 AC006369.1-201ENST00000419425 548 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CENPFP49454 LINC02096-201ENST00000445035 953 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CENPFP49454 PYDC2-201ENST00000518817 294 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CENPFP49454 AC099518.4-204ENST00000567047 380 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CENPFP49454 FOPNL-207ENST00000575073 530 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CENPFP49454 PPP2R5E-202ENST00000422769 3478 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CENPFP49454 CAND1-208ENST00000545606 11251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CENPFP49454 ZNF471-201ENST00000308031 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CENPFP49454 EYA4-203ENST00000367895 5699 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CENPFP49454 SGMS2-202ENST00000394684 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CENPFP49454 CACNA1C-225ENST00000480911 6811 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CENPFP49454 GBA3-205ENST00000511446 2018 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CENPFP49454 C7orf69-201ENST00000418326 675 ntTSL 4 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CENPFP49454 RPS27AP6-201ENST00000427962 448 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CENPFP49454 PRPF38AP2-201ENST00000438179 851 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CENPFP49454 AC068587.1-201ENST00000483613 781 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CENPFP49454 LINC00616-203ENST00000512536 568 ntTSL 4 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CENPFP49454 AC006511.5-202ENST00000546339 1198 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CENPFP49454 AC100872.1-201ENST00000577765 501 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CENPFP49454 Z98949.1-211ENST00000596813 773 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CENPFP49454 TTLL4-201ENST00000258398 4730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CENPFP49454 ZNF521-214ENST00000584787 4327 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CENPFP49454 PLXDC2-203ENST00000377252 12468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CENPFP49454 DYNC1I2-207ENST00000410079 2159 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CENPFP49454 TOR1AIP1-202ENST00000435319 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CENPFP49454 TMEM99-201ENST00000301665 2058 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CENPFP49454 SULT6B1-201ENST00000407963 902 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CENPFP49454 MIR646HG-202ENST00000426753 651 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CENPFP49454 AC097721.1-201ENST00000427150 1253 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CENPFP49454 CASC6-201ENST00000437768 733 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CENPFP49454 LINC01781-202ENST00000443104 591 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CENPFP49454 NECTIN3-AS1-205ENST00000491709 792 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CENPFP49454 AC079921.1-201ENST00000509449 946 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CENPFP49454 AC131953.1-201ENST00000513127 477 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CENPFP49454 BTF3P13-201ENST00000513224 490 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CENPFP49454 C1GALT1P3-201ENST00000522049 819 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CENPFP49454 MAL2-208ENST00000523307 556 ntTSL 4 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CENPFP49454 OR4A40P-201ENST00000533878 948 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CENPFP49454 AL121989.1-201ENST00000585888 746 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CENPFP49454 OSER1-AS1-205ENST00000623343 827 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CENPFP49454 NEDD4L-209ENST00000456986 8436 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CENPFP49454 GLYATL1-202ENST00000317391 1627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
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CENPFP49454 CFLAR-201ENST00000309955 14672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CENPFP49454 AC105235.1-201ENST00000623208 1816 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CENPFP49454 ATP9A-201ENST00000311637 7437 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
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CENPFP49454 GAPDHP42-201ENST00000406848 981 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CENPFP49454 PPP3R1-203ENST00000409752 851 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CENPFP49454 TRGV7-201ENST00000427089 353 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CENPFP49454 KCNIP1-205ENST00000434108 726 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CENPFP49454 AL161457.1-201ENST00000434656 905 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CENPFP49454 OR6D1P-201ENST00000436165 939 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CENPFP49454 AC019117.1-204ENST00000451792 442 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
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CENPFP49454 LINC01904-201ENST00000564872 861 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
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CENPFP49454 KCNMA1-266ENST00000639601 11920 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CENPFP49454 FOXJ3-203ENST00000372571 4468 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CENPFP49454 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CENPFP49454 AL080276.2-201ENST00000637995 2090 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CENPFP49454 MTOR-202ENST00000376838 4017 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CENPFP49454 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CENPFP49454 SH3YL1-203ENST00000403657 3540 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CENPFP49454 OR2J2-203ENST00000641417 2392 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CENPFP49454 RUNX1T1-252ENST00000617740 7627 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
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CENPFP49454 VDAC2P4-201ENST00000452925 711 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CENPFP49454 AC100775.1-201ENST00000590942 522 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
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CENPFP49454 Metazoa_SRP.207-201ENST00000612254 285 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CENPFP49454 OR55B1P-203ENST00000641518 2602 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CENPFP49454 PCDH15-229ENST00000616114 5846 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CENPFP49454 OSBPL9-203ENST00000428468 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CENPFP49454 ADAM18-201ENST00000265707 2388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CENPFP49454 FAM197Y3-202ENST00000427622 2325 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CENPFP49454 FAM197Y7-202ENST00000433321 2325 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CENPFP49454 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CENPFP49454 AL353625.1-202ENST00000366273 571 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CENPFP49454 AL138878.2-201ENST00000440581 1241 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CENPFP49454 ACA64.4-201ENST00000459070 127 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CENPFP49454 AC068790.7-201ENST00000602347 528 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CENPFP49454 AC069307.1-201ENST00000602820 447 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CENPFP49454 AC139493.1-201ENST00000604368 397 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CENPFP49454 E2F8-201ENST00000250024 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CENPFP49454 TOX3-202ENST00000407228 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CENPFP49454 CPNE4-214ENST00000617767 3556 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CENPFP49454 ZNF594-201ENST00000399604 4862 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CENPFP49454 GPR63-201ENST00000229955 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CENPFP49454 SUPT7L-202ENST00000404798 4114 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CENPFP49454 LINC00347-202ENST00000594461 2371 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
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