Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 HCG18-237ENST00000444126 4605 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 RGSL1-201ENST00000294854 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 ARHGAP20-206ENST00000533353 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 IQCA1-202ENST00000309507 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 ZNF605-204ENST00000392321 6156 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 ZNF528-201ENST00000360465 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 PCYT1A-204ENST00000419333 1325 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 CIR1P2-201ENST00000514821 1342 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 DAOA-AS1-201ENST00000448407 2482 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 PIGN-239ENST00000639902 4439 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 PSD3-219ENST00000614430 6136 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 SLC2A14-221ENST00000616981 3366 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 ZNF138-206ENST00000440598 2230 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 PROS2P-201ENST00000474651 1951 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 CNGA1-202ENST00000402813 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 CLEC2D-202ENST00000261340 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 MTHFD2P5-201ENST00000320415 844 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 SUGT1P2-201ENST00000379452 992 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 AL512622.1-201ENST00000414106 481 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 ODF2-AS1-201ENST00000420801 407 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 AL137071.1-201ENST00000422150 243 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 CDY8P-201ENST00000428380 1279 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 AL021408.1-201ENST00000430428 552 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 LINC02096-201ENST00000445035 953 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 LINC01880-201ENST00000446593 561 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 CDY20P-201ENST00000447528 1279 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 VN1R38P-201ENST00000450265 887 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 VAMP3-202ENST00000470357 954 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 AC007998.1-201ENST00000474156 672 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 AC012123.2-201ENST00000485809 248 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 AC117386.2-203ENST00000489690 557 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 RN7SL104P-201ENST00000498686 293 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 PSMA2P2-201ENST00000504319 686 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 SNORD46.2-201ENST00000516021 102 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 AC060775.1-201ENST00000518241 520 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 UQCRB-204ENST00000518406 595 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 LINC00534-203ENST00000523406 812 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 AC091185.1-201ENST00000523840 528 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 LINC00556-201ENST00000569603 412 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 AC020909.2-201ENST00000595005 626 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 ZNF43-209ENST00000598288 560 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 LINC01320-205ENST00000604250 857 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 AL138900.3-201ENST00000607010 629 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 AL080312.2-201ENST00000613001 630 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 REV3L-214ENST00000619481 969 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 NLRC4-202ENST00000360906 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 MID1-206ENST00000380787 5973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 TTC37-201ENST00000358746 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 ARID4A-203ENST00000395168 4051 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 GTDC1-207ENST00000409298 2209 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 SLC12A6-204ENST00000397707 4194 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 VCAM1-201ENST00000294728 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 LRRC37B-204ENST00000543378 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 RAPH1-204ENST00000418114 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 RAPH1-205ENST00000419464 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 DDX18P6-201ENST00000450119 1997 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 RALGAPA1-202ENST00000382366 6328 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 RASSF8-216ENST00000615708 1328 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 CLEC12A-203ENST00000355690 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 PIGA-206ENST00000542278 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 PMFBP1-207ENST00000537465 3935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 ZNF101P1-201ENST00000435701 1720 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 CCDC129-211ENST00000615280 4142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 OPRM1-219ENST00000522555 2440 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 DCN-218ENST00000551354 2924 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 FAM216B-202ENST00000537894 3300 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 GPAM-202ENST00000369425 5664 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 OR11H1-201ENST00000252835 982 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 TMSB4XP4-201ENST00000323496 618 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 AMELX-201ENST00000348912 737 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 AC087752.1-201ENST00000391360 558 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 CYP2AC1P-201ENST00000407830 1173 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 AC092634.4-201ENST00000419937 423 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 CYCSP52-201ENST00000422857 310 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 AL034397.2-201ENST00000424241 857 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 BRWD1P3-201ENST00000428816 390 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 LINC01372-201ENST00000430244 489 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 AC060234.3-201ENST00000430438 559 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 REG1CP-206ENST00000447469 496 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 AC092967.1-201ENST00000449016 481 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 AC022498.1-201ENST00000449845 696 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 ACA64.1-201ENST00000459171 127 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 AC008945.1-201ENST00000505144 499 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 MOCS2-206ENST00000510818 1251 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 RNA5SP271-201ENST00000516700 88 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 IGHVIII-67-4-201ENST00000524281 296 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 AP000763.3-201ENST00000542598 334 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 OLR1-210ENST00000544577 924 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 AC092652.2-201ENST00000552220 622 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 AL132800.1-201ENST00000555109 698 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 OR11H2-201ENST00000556246 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 AC051619.2-201ENST00000559063 397 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 AC048382.2-201ENST00000560239 492 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 PWRN1-210ENST00000568045 1299 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 MIR4701-201ENST00000583094 63 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 AP005136.2-201ENST00000583253 1049 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 AP000919.2-202ENST00000584431 673 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 MOCS2-210ENST00000584946 736 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
LRRTM2O43300 AC090621.1-201ENST00000592121 419 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
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