Protein–RNA interactions for Protein: O00287

RFXAP, Regulatory factor X-associated protein, humanhuman

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAPO00287 HSPD1P9-201ENST00000420325 1636 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 AC110792.3-201ENST00000595906 1614 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 CHURC1-208ENST00000607599 3615 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 MTCO1P28-201ENST00000574177 1528 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 RMDN2-207ENST00000417700 1426 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 OR2T2-203ENST00000642130 3331 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 AC007938.1-201ENST00000562524 2902 ntBASIC7□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 MORC3-201ENST00000400485 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 ZNF415-204ENST00000594011 2630 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 GDPD4-202ENST00000376217 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 NOSTRIN-209ENST00000458381 2535 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 HMBOX1-206ENST00000519047 1551 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 HACD3-211ENST00000569894 1471 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 AC096564.2-201ENST00000512428 3147 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 NPL-212ENST00000614468 2376 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 KIAA0040-202ENST00000444639 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 AC011008.2-201ENST00000624866 3352 ntBASIC7□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 PRIM2-201ENST00000274891 864 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 OR52N5-201ENST00000317093 1034 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 CAPZA3-201ENST00000317658 1087 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 LINC01620-202ENST00000372910 649 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 RPL9P21-201ENST00000392269 505 ntBASIC7□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 MIR1178-201ENST00000408396 91 ntBASIC7□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 TEX50-201ENST00000417563 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 AL133419.1-201ENST00000423153 640 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 VDAC1P2-201ENST00000423609 850 ntBASIC7□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 AC239367.3-201ENST00000428996 814 ntBASIC7□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 OSTN-AS1-201ENST00000430375 515 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 AL606490.8-201ENST00000441624 319 ntBASIC7□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 RPL34P26-201ENST00000445636 354 ntBASIC7□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 RBMY3AP-201ENST00000449381 1145 ntBASIC7□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 AC073387.1-201ENST00000453261 709 ntBASIC7□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 AC044784.1-201ENST00000456526 677 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 NAP1L1P3-201ENST00000462291 880 ntBASIC7□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 AC098847.1-201ENST00000473094 348 ntBASIC7□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 AC006539.1-201ENST00000481419 501 ntBASIC7□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 RN7SL273P-201ENST00000481561 299 ntBASIC7□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 AC104685.1-201ENST00000502445 371 ntBASIC7□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 AC006487.2-201ENST00000503624 577 ntTSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 AC008638.1-201ENST00000506035 866 ntBASIC7□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 AC104803.1-201ENST00000506917 529 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 RNU6-760P-201ENST00000516078 97 ntBASIC7□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 UQCRB-204ENST00000518406 595 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 VPS29-210ENST00000552130 1057 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 DUXAP6-201ENST00000553858 601 ntBASIC7□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 TRIM69-208ENST00000560442 1262 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 MIR4489-201ENST00000578869 62 ntBASIC7□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 TVP23B-209ENST00000581733 1258 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
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RFXAPO00287 MYL12B-204ENST00000584539 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
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RFXAPO00287 AL162591.3-201ENST00000607963 681 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC7□□□□□ -1.29
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RFXAPO00287 C8orf89-201ENST00000613105 495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
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RFXAPO00287 C8orf59-213ENST00000619594 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
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RFXAPO00287 MIR6719-201ENST00000622428 87 ntBASIC7□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 AP002782.1-201ENST00000623107 614 ntBASIC7□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 KCNMB2-201ENST00000358316 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
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RFXAPO00287 RAI14-208ENST00000506376 3091 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
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RFXAPO00287 RBM23-203ENST00000359890 10040 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
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RFXAPO00287 TGFBR3-202ENST00000370399 4550 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 ASAH1-267ENST00000637991 2399 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 A2ML1-201ENST00000299698 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 DNM1L-203ENST00000381000 4397 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 ZNF107-206ENST00000620827 5685 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 NR1H4-206ENST00000548884 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 LRRC31-202ENST00000316428 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 TRIM49-201ENST00000329758 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 TRIM49C-201ENST00000448984 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 TRIM49B-202ENST00000622138 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 ZNF33B-201ENST00000359467 5958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 LINC00536-201ENST00000505156 2692 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 FOXP2-217ENST00000462331 1388 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 HSD17B4-202ENST00000414835 2551 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 SLC14A1-208ENST00000586142 2846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 RTN4-205ENST00000394609 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 CCDC169-201ENST00000239859 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 RPS7-201ENST00000304921 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 RNA5SP110-201ENST00000362638 115 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 RNU6-623P-201ENST00000363143 105 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 Y_RNA.201-201ENST00000364052 96 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 S100A1-202ENST00000368696 522 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 CCDC169-203ENST00000379862 624 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 RNA5SP284-201ENST00000384547 118 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
RFXAPO00287 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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