Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,791 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 LINC01138-208ENST00000639159 1521 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SCN11AQ9UI33 OR1M1-202ENST00000641627 2535 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SCN11AQ9UI33 RAPH1-209ENST00000439222 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SCN11AQ9UI33 LINC01958-201ENST00000637749 1941 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SCN11AQ9UI33 AC092070.2-203ENST00000598377 3644 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SCN11AQ9UI33 WFDC11-201ENST00000324384 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SCN11AQ9UI33 MIR133B-201ENST00000362210 119 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SCN11AQ9UI33 RN7SKP28-201ENST00000364770 305 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SCN11AQ9UI33 RBMS3-AS2-201ENST00000366321 582 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SCN11AQ9UI33 GAPDHP42-201ENST00000406848 981 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SCN11AQ9UI33 METTL15P3-201ENST00000415522 1221 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SCN11AQ9UI33 CNOT7P2-201ENST00000441051 832 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SCN11AQ9UI33 AC245047.2-201ENST00000441060 530 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SCN11AQ9UI33 AC055758.1-201ENST00000494509 569 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SCN11AQ9UI33 AC105420.1-201ENST00000504389 582 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SCN11AQ9UI33 AF117829.1-208ENST00000521996 915 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SCN11AQ9UI33 POLR2K-203ENST00000522439 543 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SCN11AQ9UI33 LINC01580-201ENST00000555255 561 ntTSL 4 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SCN11AQ9UI33 AC087477.5-202ENST00000560242 389 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SCN11AQ9UI33 RBM22P12-201ENST00000567098 1255 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SCN11AQ9UI33 AC011824.2-202ENST00000578602 533 ntTSL 4 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SCN11AQ9UI33 METTL15-211ENST00000634762 718 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SCN11AQ9UI33 CASC19-222ENST00000641321 1173 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SCN11AQ9UI33 IFIT1B-201ENST00000371809 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SCN11AQ9UI33 UQCC1-208ENST00000397554 3638 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SCN11AQ9UI33 KLHL5-203ENST00000381930 3288 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SCN11AQ9UI33 NBPF12-206ENST00000617844 6326 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SCN11AQ9UI33 CYP4Z2P-201ENST00000423332 1512 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SCN11AQ9UI33 RGPD2-203ENST00000638730 5306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SCN11AQ9UI33 AKAP13-203ENST00000394518 13215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
SCN11AQ9UI33 SDAD1-201ENST00000356260 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
SCN11AQ9UI33 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SCN11AQ9UI33 VCAM1-201ENST00000294728 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
SCN11AQ9UI33 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SCN11AQ9UI33 RNF145-201ENST00000274542 3364 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SCN11AQ9UI33 BZW1-203ENST00000409600 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
SCN11AQ9UI33 PLEKHS1-205ENST00000369312 3443 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SCN11AQ9UI33 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SCN11AQ9UI33 OR2G3-201ENST00000320002 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.23
SCN11AQ9UI33 SNORD8-201ENST00000363915 110 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
SCN11AQ9UI33 TRAV9-1-201ENST00000390431 338 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.23
SCN11AQ9UI33 KCNJ13-202ENST00000409779 1099 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
SCN11AQ9UI33 AC116036.1-201ENST00000412199 367 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
SCN11AQ9UI33 AL353693.1-201ENST00000429567 442 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.23
SCN11AQ9UI33 AC009948.1-206ENST00000436616 1020 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.23
SCN11AQ9UI33 CYCSP12-201ENST00000437729 300 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
SCN11AQ9UI33 AURKAPS1-201ENST00000451805 1212 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
SCN11AQ9UI33 APOPT1-204ENST00000473127 739 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.23
SCN11AQ9UI33 TRBV5-2-201ENST00000489095 273 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
SCN11AQ9UI33 AC008953.1-201ENST00000497334 318 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
SCN11AQ9UI33 AC116424.1-203ENST00000513940 671 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.23
SCN11AQ9UI33 RNA5SP92-201ENST00000516437 110 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
SCN11AQ9UI33 WASHC5-AS1-201ENST00000519140 587 ntTSL 4 BASIC7.4□□□□□ -1.23
SCN11AQ9UI33 AP001970.1-201ENST00000531681 701 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.23
SCN11AQ9UI33 CDKN3-206ENST00000541304 1070 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
SCN11AQ9UI33 C8orf59-206ENST00000545322 491 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.23
SCN11AQ9UI33 AC091544.7-201ENST00000554000 240 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.23
SCN11AQ9UI33 LINC01895-201ENST00000558690 404 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
SCN11AQ9UI33 LINC02129-201ENST00000564381 692 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
SCN11AQ9UI33 AC090457.1-201ENST00000579775 211 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.23
SCN11AQ9UI33 AC003682.1-201ENST00000599190 462 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
SCN11AQ9UI33 ZNF208-204ENST00000599916 740 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
SCN11AQ9UI33 AL512329.2-201ENST00000607350 548 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
SCN11AQ9UI33 PROX1-201ENST00000261454 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
SCN11AQ9UI33 OR2J3-202ENST00000641151 3297 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.23
SCN11AQ9UI33 RAB14-201ENST00000373840 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
SCN11AQ9UI33 CLSPN-202ENST00000318121 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SCN11AQ9UI33 SMIM21-203ENST00000584508 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SCN11AQ9UI33 ANO4-201ENST00000392977 3509 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SCN11AQ9UI33 AFP-201ENST00000226359 1914 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SCN11AQ9UI33 TGIF1-204ENST00000400167 1352 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SCN11AQ9UI33 AL161912.4-201ENST00000623889 2468 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SCN11AQ9UI33 CDK12-202ENST00000447079 8336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SCN11AQ9UI33 SENP8-202ENST00000542035 1672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SCN11AQ9UI33 ATP1B4-203ENST00000539306 4644 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SCN11AQ9UI33 OR52N1-202ENST00000641645 2545 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SCN11AQ9UI33 ARHGAP32-203ENST00000524655 8194 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SCN11AQ9UI33 TMTC3-201ENST00000266712 7203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SCN11AQ9UI33 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SCN11AQ9UI33 BTBD9-203ENST00000403056 1155 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SCN11AQ9UI33 AL163193.1-201ENST00000444895 788 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SCN11AQ9UI33 MORF4L1P4-201ENST00000450245 976 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SCN11AQ9UI33 AC099521.1-201ENST00000482557 334 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SCN11AQ9UI33 RPS21P4-201ENST00000487122 248 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SCN11AQ9UI33 OR10G5P-201ENST00000532733 358 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SCN11AQ9UI33 AC066613.1-201ENST00000559977 1053 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SCN11AQ9UI33 AC106730.2-201ENST00000566641 540 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SCN11AQ9UI33 AL136311.1-213ENST00000586466 520 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SCN11AQ9UI33 SUGT1P3-202ENST00000604259 383 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
SCN11AQ9UI33 LINC01685-203ENST00000634464 1201 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SCN11AQ9UI33 SLAMF6-202ENST00000368057 2712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SCN11AQ9UI33 AC021205.3-201ENST00000609680 1709 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SCN11AQ9UI33 MEMO1-202ENST00000379383 1498 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SCN11AQ9UI33 ALG2-202ENST00000319033 1627 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SCN11AQ9UI33 PRLR-208ENST00000509140 1610 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SCN11AQ9UI33 KCNAB1-212ENST00000490337 3122 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SCN11AQ9UI33 CSPP1-201ENST00000262210 4367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SCN11AQ9UI33 WDR72-208ENST00000614174 4224 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
SCN11AQ9UI33 RTN4-203ENST00000357376 4110 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
SCN11AQ9UI33 AL158064.2-203ENST00000639897 2003 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
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